重庆脑外科比较好的医院是陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、陆军军医大学新桥医院，陆军军医大学第一附属医院的神经外科为西南地区唯一的神经外科学国家重点学科，也是中国西部地区最大的神经外科专科中心之一。重庆医科大学附属第一医院神经外科整体实力和医疗水平达到国内先进水平，名列西南前茅，陆军军医大学新桥医院神经外科是西南地区规模最大、设备最先进、开展临床诊疗技术最多的神经外科专科病房。
第一名：陆军军医大学第一附属医院-神经外科
陆军军医大学第一附属医院神经外科，为西南地区唯一的神经外科学国家重点学科、全军神经外科研究所及唯一的神经外科学军队医学重点实验室和军队后勤重点实验室、军队首批研究型学科建设试点单位、重庆市重点学科。是临床医学博士后流动站站内学科，博士、硕士授予权学科，国家神经外科专科医师培训基地。现展开床位160张，由3个普通病区（床位130张）、1个神经重症监护室(床位30张)、胶质瘤治疗中心、脑血管病诊治中心、脑磁图与癫痫诊治中心、高压氧治疗中心组成；年收治颅脑与脊髓创伤、脑与脊髓肿瘤、脑血管病、癫痫、脑积水、新生儿脑与脊髓膨出、三叉神经痛、面肌痉挛、糖尿病足、老年性痴呆、帕金森病等病人4000余人次，年手术2000余台次，是中国西部地区最大的神经外科专科中心之一。
第二名：重庆医科大学附属第一医院-神经外科
重庆医科大学附属第一医院神经外科，是西南地区最早建成的神经外科之一。科室先后被批准为国家临床重点专科（建设项目）、重庆市重点学科、重庆市医学重点学科、重庆市神经外科诊疗中心、重庆市神经外科医疗质量控制中心、博士及硕士学位授权点、博士后流动站。现已发展出脑脊髓血管疾病、神经肿瘤、脊髓脊柱、功能神经外科、神经重症、颅脑损伤6个亚专业，形成了5个医疗组，已成为集医疗、科研、教学为一体的综合性学科，整体实力和医疗水平达到国内先进水平，名列西南前茅。
第三名：陆军军医大学新桥医院-神经外科
陆军军医大学新桥医院神经外科，是我国最早创建的神经外科之一，是西南地区规模最大、设备最先进、开展临床诊疗技术最多的神经外科专科病房。学科整体已达到国内大型综合医院神经外科先进水平。已在“药物难治性顽固性癫痫的外科治疗”、“脑血管疾病的外科及血管内介入治疗”、“颅底微创外科及颅脑肿瘤的显微外科治疗”和“伽玛刀立体定向放射神经外科治疗”、“伽玛刀立体定向放射神经外科治疗”等方面形成学科特色和优势。
第四名：重庆大坪医院-神经外科
重庆大坪医院神经外科，已发展成为集医、教、研为一体的国家级重点学科。开展功能神经外科，在西南地区迅速发展，位居前列。目前科室在颅内、脊髓肿瘤的显微外科手术治疗，脑血管病的手术及介入治疗，重型颅脑损伤的救治，垂体瘤的单鼻孔经蝶手术治疗，癫痫神经痛及面肌痉挛等功能性疾病的外科手术治疗上形成特色。
第五名：重庆医科大学附属第二医院-神经外科
重庆医科大学附属第二医院神经外科，现已发展成为装备现代化、技术精良的现代微侵袭神经外科中心。具备显微神经外科、神经内镜、神经介入、立体定向功能神经外科等先进设备与技术，在脑血管疾病、颅内肿瘤和功能神经疾病的诊治方面积累了丰富的经验。学科技术力量雄厚，医疗、教学、科研总体实力处于国内先进水平，为西南地区重要神经外科医师培养基地之一。
第六名：重庆市人民医院-神经外科
重庆市人民医院神经外科，为重庆市重点学科。科室在广泛开展显微神经外科手术基础上，率先建立微创神经外科技术平台，全面开展和临床应用显微神经外科技术、神经内窥镜技术、立体定向和功能神经外科技术、神经介入技术，并开设垂体瘤、脊柱脊髓、神经肿瘤、脑血管病专病门诊以及筹建帕金森病特色诊疗中心，现已成为集医疗、科研、教学为一体的综合性学科，整体实力和医疗水平达国内先进水平。
第七名：重庆市中医院-神经外科
重庆市中医院神经外科，完善的颅脑、脊柱脊髓创伤及周围神经损伤综合救治能力，主要病种包括：头皮血肿、颅骨骨折、颅内血肿、脑挫裂伤、脑干损伤、外伤性蛛网膜下腔出血、脑积水；颈椎、胸腰椎骨折伴脊髓损伤；周围神经损伤（正中神经、尺神经、桡神经损伤）等。针对自发性蛛网膜下腔出血、颅内动脉瘤、脑血管畸形等，医院及科室顺畅的绿色抢救通道，已成功挽救了众多患者的生命。
第八名：重庆市第九人民医院-神经外科
重庆市第九人民医院神经外科是重庆北部地区专业人才最密集、技术最成熟、设备最先进，规模最大、综合实力最强的神经外科疾病诊治中心。能够常规开展颅脑及椎管内肿瘤显微切除术、颅内动脉瘤显微夹闭术，脑血管畸形显微切除术、颅内动脉瘤、脑血管畸形、动静脉瘘等脑血管疾病的微创介入治疗。
第九名：重庆市南川区人民医院-神经外科
重庆市南川区人民医院神经外科，在神经外科常见病、多发病及神经疑难危重症诊治和抢救方面积累了丰富的临床经验，建立了系统的诊治及抢救方案，形成了自己的专科特色。在创建卒中中心的同时，在脑血管疾病治疗以及推进分级诊疗方面做了大量工作，开展了脑出血治疗显微、微创的各种方式手术，开展了动脉瘤夹闭及介入的治疗。
