全国胆结石医院排名第一的是北京协和医院，需就诊于肝胆外科，该医院肝脏外科开展的治疗项目广泛，拥有强大的综合诊治平台，成功的诊治了多种肝胆系统疑难杂症。此外，还比较推荐四川大学华西医院肝胆胰外科、中国人民解放军总医院肝胆胰外科医学部，其中四川大学华西医院肝胆胰外科在国内具有重要影响力和学术地位的学科，中国人民解放军总医院肝胆胰外科医学部是国内享有盛誉的肝胆胰外科中心。
第一名：北京协和医院-肝脏外科
北京协和医院肝脏外科是国内开展肝脏切除手术最早的医院之一。科室开展的治疗项目包括肝脏良恶性疾病的诊断和治疗、肝脏移植、腹部疑难杂症及其它相关疾病的诊治等。依托医院强大的综合诊治平台，科室成功的诊治了多种肝胆系统疑难杂症，如常见的胆结石，同时包括世界首例的肝脏原发上皮-肌上皮癌病例。
第二名：四川大学华西医院-肝胆胰外科
四川大学华西医院肝胆胰外科目前已经成为一个技术力量雄厚，人才梯队合理，在国内具有重要影响力和学术地位的学科。科室以疑难肝胆胰疾病的诊治和微创手术为特色，在国内首先提出重症化脓性胆管炎分级诊断标准和治疗原则。首先建立化脓性胆管炎和肝内胆管结石动物模型，以它为载体对胆石成因的研究已经深入到基因水平，是全国乃至亚洲相关领域研究最系统、最广泛和最深入的基地。
第三名：中国人民解放军总医院-肝胆胰外科医学部
中国人民解放军总医院肝胆胰外科医学部是集肝胆胰战创伤救治、疑难危重病诊治、临床科技创新和军地高层次人才培养为一体的享有盛誉的肝胆胰外科中心。微创手术尤其是机器人手术是学部核心技术特色，机器人肝胆胰年手术量稳居世界首位。对于胆结石等复杂胆道病的外科治疗始终位居国际领先水平。在国际上率先报道腹腔镜肝门部胆管癌根治术。
第四名：华中科技大学同济医学院附属同济医院-肝脏外科
华中科技大学同济医学院附属同济医院肝脏外科建立了湖北省肝脏外科医学临床研究中心，在湖北省最早开展血管外科业务。常规开展肝脏疾病手术、移植、微创及免疫治疗，血管疾病的专业化综合治疗等诊疗项目，尤其擅长治疗原发性肝癌、肝囊肿、肝硬化、胆结石等疾病。
第五名：浙江大学医学院附属第一医院-肝胆胰外科
浙江大学医学院附属第一医院肝胆胰外科为全国规模最大的肝胆胰中心之一，为国家重点学科、国家临床重点专科；是国家首批博士学位授权学科、国家“211工程”重点建设学科和博士后流动站。对于胆结石、各类疑难复杂肝胆胰手术、腹腔镜及机器人微创手术的完成数量均居省内领先、全国前列。
第六名：中山大学附属第一医院-肝胆胰外科中心
中山大学附属第一医院肝胆胰外科中心是住院医生规范化培训的主要教学基地之一，是该院普通外科的重要分支。临床主要收治肝胆胰外科疾病病人，包括肝脏、胆道、胰腺的良性和恶性肿瘤，主要有原发性肝癌、胆管癌、胰腺癌、胆囊癌、肝内外胆管结石、胆囊结石、胰腺良性肿等。
第七名：北京大学人民医院-肝胆外科
北京大学人民医院肝胆外科，多年来一直在肝胆外科领域享有盛誉，现为国家211工程、卫生部重点专科、国家教委博士点学科。学科作为国内最早致力于肝硬化门静脉高压症及肝癌治疗的医疗机构，在胆结石、肝硬化等肝、胆、胰、脾疾病治疗领域长期居于国内领先地位，并为全国各地培养了大批肝胆外科学科骨干。
第八名：空军军医大学西京医院-肝胆胰脾外科
空军军医大学西京医院肝胆胰脾外科是国家首批硕士、博士学位授权学科，是外科学博士后流动站。在2019年度中国医院专科声誉排行榜中名列第十。是国家教育部“211工程”重点建设学科，陕西省优势医疗专科和陕西省重点学科，国家重点培育学科，同时成立了微创治疗中心、肝癌多学科综合治疗中心、胆结石治疗中心等。
