无锡市第五人民医院擅长肝病科、性病科、传染科、感染科、结核科，上述科室均是市级或省级重点专科，具有明显的专家优势，拥有高超的诊疗水平，患者可根据实际情况选择合适的科室就诊。
1、肝病科
是无锡市重点专科，是无锡市以自身免疫性肝病为特色的疑难肝病诊治中心，集临床诊疗、教学、科研为一体，在省内外有较大的影响力。科室依靠新兴的临床诊断技术，如肝穿技术、介入技术等，着重于肝病的微创治疗，同时在药物性肝病、酒精性肝病、遗传代谢性肝病、脂肪性肝病等领域市内领先。
2、性病科
为无锡市艾滋病抗体监测定点单位，是全市唯一承担性传播疾病防治工作的市级公立诊疗机构。科室技术力量雄厚，配备全套尖端检测、治疗设备，积极开展淋菌性尿道炎、非淋菌性尿道炎、阴道炎、梅毒等疾病治疗，达该地区领先水平。
3、传染科
为市级重点专科。科室技术力量雄厚，诊疗水平精湛，在长江三角洲地区颇具影响。对出血热、乙脑、流脑等的诊疗，积累了丰富的临床经验，对慢性乙型肝炎、慢性丙型肝炎的抗病毒治疗、重症肝炎以及肝硬化的治疗，亦有独到之处。
4、感染科
系江苏省重点专科。科室现已形成自己的专科特色和优势，技术力量雄厚，诊疗水平一流。特别在乙型、丙型病毒性肝炎的个体化与优化治疗、艾滋病的个体化治疗、中枢神经系统感染诊治及新发感染性疾病诊治等方面积累了丰富的临床经验。
5、结核科
为市级临床重点专科，承担着无锡地区结核病的防治、管理任务。科室拥有电子气管镜/超声支气管镜、便携式纤维支气管镜等先进设备，配备有专业的技术团队，医术精湛，擅长肺结核含耐药性肺结核、重症结核、结核性胸膜炎等疾病的诊治，在该地区享有声誉。