乌鲁木齐肛肠外科医院排名比较靠前的是新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第二附属医院。
新疆维吾尔自治区人民医院肛肠外科是自治区级重点专科，结直肠肛门病诊疗水平全疆领先，拥有DavinciXi辅助下超低位ISR及经肛门微创手术TEM等先进技术。新疆医科大学第一附属医院肛肠科以微创手术为特色，多项改良术式荣获院级疑难杂症抢救治疗优秀奖，避免术后肛门狭窄及失禁并发症。新疆医科大学第二附属医院普外科是自治区临床重点建设学科，设有独立的肛肠专业组，微创技术优势处于自治区先进水平。
1.新疆维吾尔自治区人民医院 肛肠外科
新疆维吾尔自治区人民医院肛肠外科是自治区级重点专科，结直肠肛门病的诊疗水平全疆领先。科室拥有肿瘤遗传筛查无创基因早筛、3D可视化诊断技术等先进手段，开展基于快速康复及功能保护基础的特色治疗，熟练应用DavinciXi辅助下及腹腔镜辅助下的CME、TME、NOSES、超低位ISR、Ta-TME，结合荧光成像标识及经肛门微创手术TEM术。在便秘规范化诊疗及盆底疾病评估方面采用多手段结合外科手术，肛周疾病微创治疗涵盖RPH、LIFT及肛瘘镜辅助等技术。
2.新疆医科大学第一附属医院 肛肠科
新疆医科大学第一附属医院肛肠科以肛肠疾病诊治为重点，以微创手术为特色。科室在传统手术基础上不断改良术式，采用改良的低切高挂治疗高位马蹄形肛瘘、改良外剥内扎粘膜悬吊保留肛垫治疗环状混合痔、改良弧形闭合式内括约肌侧切治疗晚期陈旧性肛裂，既缩短住院天数、保证肛门外形美观，又避免了术后肛门狭窄、肛门失禁等并发症。开展的经会阴括约肌上行肌瓣旋转治疗肛门失禁伴直肠阴道瘘荣获院级年终疑难杂症抢救治疗优秀奖。
3.新疆医科大学第二附属医院 普外科
新疆医科大学第二附属医院普外科是自治区临床重点建设学科，技术精湛、实力较雄厚。科室内部专门设立了肛肠专业组，作为新疆首批国家外科住院医师规范化培训基地，常年承担教学及规培任务。科室配备多台腹腔镜、超声刀等国内先进设备，近年来在国内外学术刊物上发表论文80余篇，主持自治区自然基金项目五项，获得市科技进步奖一项。
4.新疆医科大学第五附属医院 普外科
新疆医科大学第五附属医院普外科是集医疗、教学、科研为一体的综合性科室。科室治疗范围广泛，明确开展各类肛肠手术。科室在急、危、重外伤病人的抢救方面诊断准确、处理及时、技术精湛，同时承担医科大学本科、专科学生临床的理论教学及临床带教工作。
5.中国人民解放军新疆军区总医院 肛肠科
中国人民解放军新疆军区总医院肛肠科在肛肠科常见病、多发病、疑难病的诊治方面具备显著优势。科室针对痔疮、肛裂、直肠脱垂、肛乳头肥大、肛周脓肿、肛瘘、慢性便秘、肠易激综合征、慢性结肠炎、直肠息肉等多种类肛肠疾患，均拥有突出的专科诊治能力，能够为患者提供专业精准的诊疗服务。
