南京精神心理科医院排名靠前的是南京脑科医院精神大科、江苏省人民医院临床心理科、南京鼓楼医院医学心理科等。南京脑科医院精神大科2023年复旦版全国专科声誉排名第6名，是卫生部国家临床重点专科、江苏省精神卫生中心主要建设单位。江苏省人民医院临床心理科是省内综合性医院中最早建立的同类科室，年门诊量万余人次，诊疗覆盖情绪障碍、心身疾病等多类精神心理问题。南京鼓楼医院医学心理科是多所高校的教学实习基地，采用生物-心理-社会模式开展诊疗服务。
1、南京脑科医院 精神大科
该科室1947年建科，2023年复旦版全国专科声誉排名第6名，2022年、2021年复旦版全国专科综合排名分别为第7名、第6名，是卫生部国家临床重点专科、江苏省临床重点专科、江苏省“兴卫工程”重点学科、江苏省精神卫生中心主要建设单位，同时为国家药品临床研究机构（精神科专业）、卫生部临床精神专科医师培训基地。科室由精神一科、精神二科、精神三科三个亚专科组成，共开放床位256张，医师团队含主任医师15名、副主任医师14名，博士生导师、硕士生导师多名。下设无抽搐电休克治疗中心，是全国率先开展该技术的单位，截至2024年末安全运行15万例，技术水平居国内领先地位。科室主持参与多项国家级、省市级科研课题，先后获中华医学奖、省科技进步奖等多个奖项，参与《中国双相障碍防治指南（第二版）》等多部全国性指南、教材编写。
2、江苏省人民医院 临床心理科
该科室创建于1999年，是省内综合性医院中最早建立的同类精神心理科室，年门诊量万余人次。科室现有主任/副主任医师4人、主治医师1人、住院医师3人、心理咨询师2人，所有人员均为研究生学历，受过正规医学心理培训。诊疗范围覆盖抑郁、焦虑、强迫、恐怖等情绪障碍，心脏、胃肠神经症，更年期综合征，躯体疾病合并心理问题，以及人际交往障碍、适应障碍、品行障碍、人格障碍、性心理障碍、应激后心理障碍等，开设临床心理科门诊、失眠专病门诊，采用心理评估、疏导和药物治疗相结合的模式开展诊疗。科室承担南京医科大学多个学院的医学心理学、护理心理学教学任务，主编《医学心理学》《康复心理学》教材，在研及完成多项科研项目。
3、南京鼓楼医院 医学心理科
该科室成立于2003年，现有临床医生8名，均拥有博士或硕士学位，其中高级职称4名，日门诊量约200人次，服务覆盖江苏省及周边省市，是南京大学医学院、徐州医科大学、南京中医药大学教学实习基地。诊疗范围涵盖焦虑障碍、抑郁障碍、双相情感障碍、睡眠障碍、强迫障碍、心身疾病、躯体形式障碍、进食障碍、性心理障碍等多类疾病。科室采用生物、心理、社会模式，以药物与心理治疗结合、中西医学与人文科学融合的方式开展诊疗。学科带头人曹秋云为主任医师、医学博士，担任江苏省中西医结合学会心身医学专业委员会主任委员等多个省级学术职务，曾获中华医学会精神病学分会优秀论文一等奖、上海市医学科技奖三等奖等荣誉。
4、东南大学附属中大医院 心理咨询科
该科室成立于2005年，是江苏省首家综合性医院设立的精神卫生专科，2010年开设病房，现有病床40张，配套设置心理治疗室、沙盘治疗室、睡眠监测室和经颅磁刺激治疗室，2014年增设心身医学诊疗中心，下辖睡眠障碍、疼痛障碍、进食障碍及酒精依赖四个专业诊疗组。科室是南京地区首家设立睡眠监测室的心理精神专科，较早引进经颅磁刺激治疗技术，对幻听、抑郁、焦虑及失眠等症状疗效显著、副作用较小。科室现有医生8人、护士15人，先后承担国家省部级科研项目6项，发表论著近200篇，其中SCI收录60余篇，主编专著11部，获中华医学科技奖一等奖、教育部自然科学奖一等奖等各级奖项10余项，还与美国佛罗里达大学联合成立国际心身医学临床研究中心。
5、东部战区总医院 心理咨询科
该科室由一批临床经验丰富的主治医师以上职称的医务人员组成。科室熟悉心理咨询科常见病、多发病、疑难病的诊治，尤其在躯体形式障碍、抑郁症、焦虑症、强迫症、青少年心理、婚姻家庭问题、适应障碍、失眠等方面的诊疗具有显著优势，可针对上述疾病及心理困扰为患者提供对应诊疗支持，覆盖不同年龄段、不同类型的精神心理问题诊疗需求。
