重庆风湿免疫科比较好的医院排名靠前的是陆军军医大学第一附属医院中西医结合科风湿病专科、重庆大坪医院风湿免疫科、重庆医科大学附属第二医院风湿免疫科等。陆军军医大学第一附属医院中西医结合科风湿病专科临床经验丰富，对部分疾病的治疗方面处于国内先进水平；重庆大坪医院风湿免疫科是目前重庆市开展有关风湿免疫病诊疗手段最为完善的医院之一；重庆医科大学附属第二医院风湿免疫科是重庆市最早成立的风湿病专科之一，在重庆风湿免疫性疾病的临床中处于领先地位。
第一名：陆军军医大学第一附属医院-中西医结合科风湿病专科
陆军军医大学第一附属医院中西医结合科风湿病专科，长期致力风湿病临床与科研，在类风湿关节炎的治疗方面处于国内先进水平，同时对强直性脊柱炎、骨关节炎、银屑病性关节炎、干燥综合征等疾病也有较深入的研究，积累了丰富的临床经验。科室展设有风湿病专科实验室，并配有先进诊断治疗设备。目前已开展多种风湿病相关指标的检测，提高了强直性脊柱炎、系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、骨关节炎等风湿病的早期诊断率。
第二名：重庆大坪医院-风湿免疫科
重庆大坪医院风湿免疫科，是重庆市各大医院中首家开设的独立西医风湿免疫科，也是目前重庆市开展有关风湿免疫病诊疗手段最为完善的医院之一。开展了皮肤肌肉活检，淋巴结活检，唇腺活检等诊疗技术，使用生物制剂益赛普、恩利、类克、修美乐、雅美罗治疗类风湿性关节炎，白塞氏病等自身免疫性疾病，并与国内及国际风湿病诊疗水平接轨，积极开展了新技术、新方法，用免疫吸附治疗难治性类风湿性关节炎及干燥综合征，并取得良好效果。
第三名：重庆医科大学附属第二医院-风湿免疫科
重庆医科大学附属第二医院风湿免疫科，是重庆市最早成立的风湿病专科之一、在重庆风湿免疫性疾病的临床、科研、教学中处于领先地位，是集医教研于一体的的风湿免疫专病诊治科室。科室拥有先进的诊疗技术，对疑难重症风湿免疫性疾病有丰富的临床经验，主要对针对自身免疫性疾病以及自身炎症性疾病进行治疗，包括：类风湿关节炎，系统性红斑狼疮，干燥综合征等。
第四名：重庆市第九人民医院-中西医结合(风湿免疫)
重庆市第九人民医院中西医结合(风湿免疫)科，为重庆市中医药重点风湿专科。科室拥有先进的微创针刀镜设备，利用微创可视技术，是普通针灸和开刀手术无法替代的新技术。对各种风湿病关节顽固性肿痛、疑难重症关节炎进行精准诊断、腔内治疗。深入开展中西医结合治疗风湿免疫疾病，采用针炙、刮痧、拨罐、推拿按摩、中药内治与外用、口服与灌肠同施的多种中医药特色治疗手段，如：对类风湿关节炎采取活血化瘀，豁痰通络的方法等，临床效果显著。
第五名：重庆市第六人民医院-肾病风湿科
重庆市第六人民医院肾病风湿科，拥有世界一流的设备，技术力量强大，业务骨干均为长期从事肾内科及血液净化的专科医生及护士，科室对常见肾脏疾病、风湿免疫疾病、中毒的治疗具有满意的疗效，得到了广大患者的好评。
第六名：重庆医科大学附属永川医院-风湿免疫科
重庆医科大学附属永川医院风湿免疫科，是院级重点建设学科之一。是渝西地区规模最大的腹透中心和永川区规模最大的血透中心。对各种原发性、继发性肾脏疾病、急、慢性肾功能不全、终末期肾脏病的诊治达重庆市先进水平。对各种急性中毒、危重疾病（如MODS、ARDS、脓毒症伴AKI、重症胰腺炎、顽固性心衰、严重电解质酸碱平衡紊乱等）的血液净化治疗有丰富的临床经验。
第七名：重庆市第四人民医院-免疫风湿科
重庆市第四人民医院免疫风湿科，是集免疫风湿疾病医疗、教学、科研为一体的专业科室，为西南免疫风湿病专科联盟成员单位，国家级住院医师规范化培训内科及全科专业轮训科室。科室技术力量雄厚，为系统性红斑狼疮、成人斯蒂尔病、银屑病关节炎、痛风性关节炎、骨关节炎、骨质疏松症等多种免疫风湿病患者提供规范的诊断和治疗。尤其擅长结缔组织病相关肺间质疾病、肺动脉高压、肺部感染等多种肺部疾病的诊治。
第八名：重庆市开州区人民医院-血液·风湿免疫科
重庆市开州区人民医院血液·风湿免疫科，是重庆市区县级医院成立较早的血液、风湿免疫专科。该科为中国血液病专科联盟两江区域联盟成员单位、巴渝血液病专科联盟成员单位、重庆血友病专科联盟成员单位、西南风湿免疫疾病专科联盟成员单位、淋巴肿瘤规范治疗与协同创新中心成员单位，有力促进了学科的建设发展。
第九名：重庆三峡中心医院-血液风湿内科
重庆三峡中心医院血液风湿内科是渝东北片区唯一的血液病专科，万州区医学重点学科，并成为中国血液科专科联盟两江区域联盟成员单位，是集医疗、教学、科研为一体的临床学科，为本地区及周边辐射地区1600多万人民提供医疗服务，现已形成了适合地域特点的诊疗技术和方法。
第十名：重庆市垫江县人民医院-风湿病科、中西医结合科
重庆市垫江县人民医院风湿病科、中西医结合科，是国家中医管理局重点风湿骨病专科协作单位、重庆市综合医院示范中医科，设综合内科、中医针灸理疗、风湿专科、失眠专科4个专业。主要运用现代医学理论为基础，结合传统中医中药，配合针炙理疗，开展内科系统疾病、老年病、慢性病等疾病的诊疗以及疑难杂症诊治。