南京中医内分泌科医院排名比较靠前的是江苏省中医院、南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院。
江苏省中医院内分泌科是江苏省中医重点专科、江苏省消渴病诊疗中心，科研与临床实力国内先进、省内领先，中西医结合诊治代谢类疾病优势突出。南京医科大学第一附属医院中医科是首批全国综合医院中医药工作示范单位，名医云集，门诊量居全国综合医院中医内科首位，擅长疑难病中西医结合诊疗。南京鼓楼医院中医科是江苏省综合医院临床重点专科与质量控制中心，硕博士培养点，多项特色针灸及中医诊疗技术国内领先。
1.江苏省中医院 内分泌科
江苏省中医院内分泌科为江苏省中医重点专科、江苏省消渴病诊疗中心，医教研水平国内先进、省内领先。科室拥有国务院特殊津贴专家、省级名中医及多位国家级学会主委、副主委，科研实力雄厚，主持国家科技部重大攻关课题、国家自然科学基金等多项项目，获多项省级科技进步奖。
擅长糖尿病及并发症、代谢性脂肪性肝病、甲状腺疾病、痛风、骨质疏松等中西医结合治疗，自研8种特色中药制剂疗效确切，配备全套先进诊疗设备，在糖尿病肾病、脂肪肝、甲状腺疾病等领域达到国内领先水平。
2.南京医科大学第一附属医院 中医科
南京医科大学第一附属医院中医科是首批全国综合医院中医药工作示范单位、国家药物临床试验机构，集临床、教学、科研于一体。科室汇聚国务院特殊津贴专家、省名中医及省级中医药领军人才，设中医消化、风湿免疫、内分泌心脑血管、肾病男科四大亚专科，门诊量居全国综合医院中医内科首位。
擅长胃肠癌前期病变逆转、风湿免疫病、肿瘤调治、内分泌疾病、不孕不育、心脑血管疾病等疑难杂症，中西医结合诊疗水平省内领先。
3.南京鼓楼医院 中医科
南京鼓楼医院中医科是江苏省综合医院临床重点专科、中医专业质量控制中心，为高校硕博士培养点及临床教学基地。科室在针灸推拿骨伤、中医肿瘤、脾胃病、肾病等领域特色鲜明，麦粒灸、八髎穴深刺、蝶腭神经节芒针速刺等特色技术国内领先，开展心身疾病多学科联合诊疗。
承担国家及省部级科研课题，荣获省市级中医药科技进步奖。擅长多囊卵巢综合征、更年期综合征、糖尿病及并发症、重度骨质疏松症等中西医及针药结合治疗。
4.东南大学附属中大医院 中医内科
东南大学附属中大医院中医内科是江苏省综合医院示范中医科、东南大学硕士授予点。科室专家在省级中医药及中西医结合学会担任重要职务，承担各级科研课题，发表多篇学术论文。
科室擅长失眠、肿瘤、亚健康、心脑血管、脾胃肝胆、肾病、糖尿病、妇科病等中医诊疗，将传统辨证与现代经络检测、通络治疗仪结合，形成特色诊疗体系。
5.南京市第一医院 中医科
南京市第一医院中医科是集医疗、教学、科研于一体的一级临床科室，高学历人才占比高。科室以“调脾胃、祛湿气”为核心特色，运用系统祛湿法调理体质，在功能性胃肠病、肿瘤、慢性咳嗽、更年期综合征、顽固性失眠、内分泌紊乱等方面经验丰富。
针灸科开展针刺、艾灸、小针刀、穴位埋线等综合疗法，擅长面瘫、颈肩腰腿痛、中风后遗症、带状疱疹后遗神经痛等病症，常年开展冬病夏治三伏贴、三伏灸，对虚寒性疾病疗效显著。
