治疗淋巴结核比较好的医院是首都医科大学附属北京胸科医院、上海市肺科医院、深圳市第三人民医院，首都医科大学附属北京胸科医院的结核科能够规范化诊治各类结核病及相关疾病，部分已达国际领先水平。上海市肺科医院结核科在中国医院科技影响力排行榜名列结核病专科排名国内第二；深圳市第三人民医院结核病科是国家感染性疾病（结核病）临床医学研究中心、中国医学科学院深圳传染性疾病诊疗研究中心。
第一名：首都医科大学附属北京胸科医院-结核科
首都医科大学附属北京胸科医院的结核科，能够规范化诊治各类结核病及相关疾病，肺部疾病的鉴别诊断和常见肺部疾病的规范化诊治等；对难治性耐药结核病(如耐多药、广泛耐药结核病)、难治性结核性脑膜炎、难治性支气管结核、脊柱结核伴截瘫、淋巴结核、复杂性难治性结核性脓胸、严重基础疾病合并结核病、特殊人群结核病等诊治具有丰富的经验，部分已达国际领先水平；率先在国内开展多项诊断新技术、新方法用于结核病和耐药结核病的诊断。
第二名：上海市肺科医院-结核科
上海市肺科医院结核科为中华医学会结核病学分会和中国防痨协会的发源地，中国医疗保健国际交流促进会结核病防治分会和上海市医学会结核病学专科分会创建单位，医院结核病临床研究中心囊括了上海市“重中之重”临床重点科室和上海市结核病（肺）重点实验室。作为上海市耐多药专家组组长单位，以诊治肺结核、淋巴结核等疑难、危重和耐多药结核病为特色，指导全市耐多药肺结核鉴别诊断及治疗工作。
第三名：深圳市第三人民医院-结核病科
深圳市第三人民医院结核病科是国家感染性疾病（结核病）临床医学研究中心、中国医学科学院深圳传染性疾病诊疗研究中心。在治疗结核病方面，专门成立了肺病一科、肺病二科、肺病三科及肺科门诊。在肺结核、淋巴结核的治疗方面经验丰富，为广东省结核病临床医学研究中心，国家感染性疾病临床医学研究中心。为国家感染病临床重点专科亚专科，广东省临床重点专科，国家结核病药物临床研究基地，深圳市结核病临床重点专科，为硕士学位授权点。
第四名：上海市公共卫生临床中心-呼吸结核科
上海市公共卫生临床中心-呼吸结核科是上海市结核病诊治定点三甲医院之一，也是上海市唯一的儿童结核病定点收治单位。 科室承担了上海市结核病诊治和管理的重要任务，具有系统完善的结核病诊治和管理方案，并及时更新各项SOP。收治病种有淋巴结核、肺结核、肺外结核、儿童结核病、妊娠结核病、播散性卡介菌病及结核病合并全身其他疾病；在危重症结核病及难治性结核病救治方面积累了丰富的临床经验，比如结核性脑膜炎、重症肺结核、播散性卡介菌病、耐多药结核病等的救治。
第五名：山东省公共卫生临床中心-结核内科
山东省公共卫生临床中心结核内科为山东省医药卫生重点学科，是山东省最权威的结核病治疗单位,部分诊疗技术水平部分已达到国内及国际先进水平。作为全省结核外科疾病的诊治中心，科室对于结核性病变，包括结核空洞、结核球、结核性脓胸、胸壁结核等诊治方面具有独特优势，对淋巴结核，胸壁结核，结核性脓胸，结核性毁损肺，结核球，骨结核，腹腔各部位结核等疾病的治疗达国内领先水平，对耐药性肺结核和非典型性结核杆菌引起的疾病的治疗有独到之处，已形成一套行之有效的治疗方法，具有治疗彻底、疗程短、复发少等优势。
第六名：中国人民解放军总医院-结核病科
中国人民解放军总医院结核病医学部，是全军唯一的结核病临床诊疗、预防保健和科研教学为一体的综合性学部，是国家重点学科呼吸内科的重要组成部分，是国家中西医结合治疗结核病重点学科、全军首批国家临床重点专科建设单位、全军结核病防治技术指导组组长单位、北京地区结核病定点和结核病孕产妇指定收治结构，在肺、淋巴的结核治疗方面经验丰富。
第七名：四川大学华西医院-结核科
四川大学华西医院结核专科前身为成都肺病疗养院，后合并入四川医学院附属医院内科，目前隶属于华西医院呼吸与危重症医学科。2016年被评为全国结核专科排名第4名，是四川省医学会结核病学学组发起单位和组长单位。科室承担大量院内淋巴结核、肺结核的诊治工作。
第八名：复旦大学附属华山医院-感染病科
复旦大学附属华山医院感染病科为国家教委首批重点学科，数十年来在诊治经典传染病及感染病的医疗、教学、科研工作中已形成学科特色和优势，是国内重要的病毒性肝炎相关肝病、淋巴结核和其他感染病临床医疗中心之一。
第九名：浙江大学医学院附属第一医院-感染病科
浙江大学医学院附属第一医院感染科是集医疗、教学和科研全面发展的国家重点学科、国家重点实验室、国家协同创新中心、国家临床医学研究中心、传染病国家医学中心和重点临床专科建设单位，是国内规模最大、学术水平领先的感染病教学、科研和临床基地之一，在病毒性肝炎、淋巴结核等疾病诊治方面取得重大突破。
第十名：北京协和医院-感染内科
北京协和医院感染内科是北京协和医院最早成立的科室之一，现已成为国内一家集医疗、科研、预防和人才培养的国家级传染病的医疗诊治、医学教育和医学研究中心。北京协和医院感染科是感染性疾病博士学位授予点、卫生部临床重点学科，擅长淋巴结核、肝炎等疾病的治疗。在复旦大学医院管理研究所最佳专科声誉排行榜名列第七。