重庆小儿眼科比较厉害的三个医院是陆军军医大学第一附属医院、重庆医科大学附属第一医院、重庆医科大学附属儿童医院。
陆军军医大学第一附属医院眼科历史悠久、技术雄厚，干细胞治疗视网膜变性居国际领先。重庆医科大学附属第一医院眼科是国家临床重点专科，葡萄膜炎诊治达世界领先水平。重庆医科大学附属儿童医院眼科专注儿童眼病，特色诊疗技术成熟。
1、陆军军医大学第一附属医院 眼科
陆军军医大学第一附属医院眼科始建于1929年，依托三级甲等医院优势，人才梯队完善，拥有多名国家级人才和高职称医师。科室分区诊疗、设备先进，年门诊量达19万余人次，开展全眼科专科项目，干细胞治疗视网膜变性研究居国际领先，科研实力强劲，是硕博授权点及博士后流动站。
2、重庆医科大学附属第一医院 眼科
重庆医科大学附属第一医院眼科有60余年历史，是国家临床重点专科、重庆市眼科医疗质量控制中心。科室人才济济，设备先进，在葡萄膜炎领域达世界领先水平，是国际单一机构最大葡萄膜炎诊治中心，角膜病、白内障等诊疗达国内先进，科研成果丰硕。
3、重庆医科大学附属儿童医院 眼科
重庆医科大学附属儿童医院眼科专注儿童眼病诊疗，范围涵盖儿童屈光不正、斜视、弱视、先天性眼病及眼外伤等。科室特色优势显著，擅长近视防控、微创玻璃体切割、视网膜母细胞瘤综合治疗等技术，配备专业诊疗团队，在渝中和两江院区均设有诊疗站点，服务便捷。
4、陆军军医大学新桥医院 眼科
陆军军医大学新桥医院眼科创建于1950年，现已跻身西南地区眼科前列。科室引入先进医疗设备，人才实力雄厚，学科带头人擅长玻璃体视网膜疾病外科治疗及眼底病诊治，较早开展微创玻璃体手术，在早产儿视网膜病变筛查治疗、黄斑疾病诊治等方面达国内先进水平。
5、重庆大坪医院 眼科
重庆大坪医院眼科创建于1960年，2010年成立眼科专科医院，设十个特色专科。科室医护团队庞大，拥有多名高职称、高学历医师，设备先进，年门诊33万人次、手术2.8万台次，在疑难青光眼、白内障、近视矫正等方面达国内先进，连续多年跻身全国医院专科声誉排行榜提名。
