上海咳嗽去上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院等医院好。上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸科为国家临床重点专科，每天的门诊量位于上海市三级医院呼吸科的前列；复旦大学附属中山医院呼吸科是国内最早建立的肺病学研究室；复旦大学附属华山医院呼吸科在肺部感染性疾病、气流阻塞性肺疾病等方面的诊疗，达到国内先进水平。
第一名：上海交通大学医学院附属瑞金医院-呼吸科
上海交通大学医学院附属瑞金医院呼吸科为国家临床重点专科，获评上海市呼吸内科质控检查第1名。科室拥有独立的门急诊，疑难危重疾病的收治率达40%左右。拥有上海交通大学医学院慢性气道疾病诊治中心、睡眠监测、疑难胸腔疾病会诊、胸腔疾病介入诊疗、呼吸重症病5个诊疗中心及7个专病门诊。呼吸科门诊由呼吸科高年资医师坐诊，参与制订哮喘、慢性咳嗽、COPD、睡眠呼吸疾病和社区获得性肺炎等诊疗指南和共识。
第二名：复旦大学附属中山医院-呼吸科
复旦大学附属中山医院呼吸科是由肺科发展而来，是国内最早建立的肺病学研究室。科室先后入选上海市医学重点学科、上海市重点学科。2012年获批上海市“重中之重”临床重点学科，同年入选首批国家卫生和计划生育委员会临床重点专科建设项目。2015年入选上海市公共卫生重点学科建设项目。2017年再次获批上海市“重中之重”临床重点学科。开展咳嗽、重症肺炎的临床试验，并积累了中西医结治疗上述病症的经验。
第三名：复旦大学附属华山医院-呼吸科
复旦大学附属华山医院呼吸科先后成立了中国肺癌联盟肺部小结节早期诊断分中心、肺血管病诊疗中心、慢性气道疾病防治中心、肺部疾病介入诊疗中心等，每年吸引大量来自华东地区乃至全国的疑难、危重呼吸病患者。科室在咳嗽、肺部感染性疾病、气流阻塞性肺疾病、肺部肿瘤、肺循环疾病、弥漫性肺部疾病、胸膜疾病、通气调节功能障碍性疾病、呼吸系统危重症等方面的诊疗与研究优势显著，达到国内先进水平，并逐步与国际水平接轨。
第四名：上海交通大学医学院附属仁济医院-呼吸科
上海交通大学医学院附属仁济医院呼吸科是上海交通大学医学院博士授予权学科、上海市呼吸专科培训基地等，目前以肺癌的综合诊治、间质性肺病、慢性气道炎症性疾病、肺部感染、胸膜疾病等为分支的内科重要学科。另外开展的项目还有经皮肺穿刺、局麻下胸膜固定术、胸腔积液局麻下胸膜活检等，对咳嗽的治疗也具有丰富的经验。
第五名：上海交通大学医学院附属第九人民医院-呼吸内科
上海交通大学医学院附属第九人民医院呼吸内科目前主要收治哮喘、咳嗽、慢性阻塞性肺疾病(慢性支气管炎、肺气肿)、肺心病、呼吸衰竭、肺癌、肺部感染、胸腔积液、气胸、肺间质纤维化、肺栓塞及其他肺血管疾病，擅长哮喘、社区获得性肺炎和慢性阻塞性肺疾病(COPD)的规范化诊治，是第一批上海市内科住院医师培训基地之一。
第六名：上海市第六人民医院-呼吸内科
上海第六人民医院呼吸内科拥有肺功能室及气管镜室两个临床亚学科，擅长肺部疑难病症的诊断，特别是慢性咳嗽、哮喘、肺间质疾病、肺部阴影、不明原因发热等，对于危重病的治疗有丰富的临床经验，专长机械通气治疗、全麻下全肺灌洗治疗、气道狭窄的扩张和支架置入、肺癌的介入治疗等。
第七名：上海长海医院-呼吸内科
长海医院呼吸内科是国内较早组建的呼吸专科之一，2009年被批准为第二军医大学呼吸专科中心。2010年被批准为上海市住院医师规范化培训基地，2013年获批为上海市呼吸专科医师培养基地和国家呼吸内镜专科医师培训基地。目前学科拥有国内规模最大、设施最完备的呼吸病介入诊疗中心、肺癌微创专病诊治中心等部门，硬件设备精良，尤其擅长咳嗽、哮喘、肺炎等疾病的诊治。
第八名：上海市肺科医院-呼吸科
上海市肺科医院呼吸科是国家临床重点专科、国家呼吸与危重症规范化建设三级医院示范单位、上海市重中之重临床重点学科、上海市临床重点专科。2018年度中国医院科技量值（呼吸病学）排行榜全国第四，2019年度跻身复旦排行榜提名。科室在诊治慢性咳嗽、哮喘、肺间质疾病、肺部阴影等方面具有较高水平。
第九名：上海交通大学医学院附属新华医院-呼吸内科
上海交通大学医学院附属新华医院呼吸内科由我国著名呼吸病专家朱尔梅教授、何致雄教授创建，主要收治咳嗽、肺结核和其它常见呼吸系统疾病的患者。主要开展人工气胸、人工气腹、支气管碘油造影等诊断治疗项目，其中朱尔梅教授首创的气管内滴入疗法治疗肺结核空洞对我国肺结核治疗做出了重大贡献。
第十名：上海市第一人民医院-呼吸科
上海市第一人民医院呼吸科是临床重点专科，是上海交通大学医学院呼吸系统整合教学的首席单位，系我国建科最早的呼吸内科之一，在全国较早建立了呼吸危重症监护病房。科室被国家卫生部列为“国家临床重点建设专科”，其中开展的有创序贯无创通气治疗技术全国领先，同时也擅长治疗咳嗽、哮喘等病症。