深圳眼科医院比较好的是深圳市人民医院、深圳市第三人民医院、北京大学深圳医院，深圳市人民医院眼科是深圳市医学会眼科学专业委员会副主任委员单位，广东省住院医师培训基地。深圳市第三人民医院眼科整体诊疗水平居于省市前列，北京大学深圳医院的眼科为深圳市视光学会总部所在地。
第一名：深圳市人民医院-眼科
深圳市人民医院眼科是深圳市医学会眼科学专业委员会副主任委员单位，广东省住院医师培训基地。拥有各种先进的检查和治疗仪器设备，目前眼科开设了眼外伤、白内障、青光眼、视网膜病、眼表角膜病、眼肌与屈光、眼眶病与眼肿瘤等专科门诊。先后获得国家自然科学基金、省自然科学基金、省科技计划基金、深圳市科技创新委员会、深圳市科工贸信委员会科技基金资助课题等10余项。
第二名：深圳市第三人民医院-眼科
深圳市第三人民医院眼科整体诊疗水平居于省市前列，眼科开展的诊疗项目包括屈光不正（近视、远视、散光）的矫正、斜弱视的诊治、泪道疾病诊治等。近年来科室在国内外各级期刊发表学术论文，其中SCI论文3篇，国家及省市级论文10余篇。
第三名：北京大学深圳医院-眼科
北京大学深圳医院的眼科为深圳市视光学会总部所在地，是集医疗、科研、教学为一体的科室，特色优势包括各种复杂类型白内障超声乳化手术；全飞秒、半飞秒、准分子角膜屈光手术、有晶体眼人工晶体(ICL、TICL)植入术治疗各种类型屈光不正；各种复杂疑难青光眼诊断及药物、激光、手术治疗；各种玻璃体视网膜疾病的诊断及中西医药物、激光和手术治疗等。
第四名：深圳市第二人民医院-眼科
深圳市第二人民医院的眼科，为院重点学科，是在深圳市乃至广东省具有一定影响力的综合性眼科。开展玻璃体视网膜手术、白内障超声乳化手术、准分子激光矫正屈光不正等。以白内障、眼底病、眼外伤和眼视光学学科作为发展的重点，常规开展白内障超声乳化+人工晶体植入手术、复杂白内障手术、23G/25G微创玻璃体切割术，复杂前后段联合手术、复杂眼底病诊断及治疗。
第五名：中山大学附属第八医院-眼科
中山大学附属第八医院的眼科是集医疗、教学、科研和防盲为一体的专业科室，具有全面解决该专科的普通常见病及危、急、重病例特别是伴有全身病的眼病及复合眼外伤的诊治能力，目前主要开展：翼状胬肉切除+角膜缘干细胞移植术、抗青光眼手术、视网膜脱离复位术、白内障摘除及人工晶体植入术、多种类型的斜视矫正手术、严重眼外伤及眼整形等各类眼科手术。
第六名：中山大学附属第七医院-眼科
中山大学附属第七医院的眼科，是医教研三位一体的眼视光学中心，拥有一支高学历、高素质、高水平的医护团队，配备最新一代世界一流检查及治疗设备，可全面开展全飞秒屈光不正矫正、眼表疾病、白内障、青光眼、眼底病、眼眶病、眼肿瘤、眼外伤、眼部整形美容、医学验光等眼科医疗项目。
第七名：香港大学深圳医院-眼科
香港大学深圳医院的眼科，拥有先进的检查及治疗设备，学科人员结构合理，医师具备丰富的临床经验，诊断水平高超，尤其在白内障、玻璃体视网膜疾病、斜弱视、早产儿视网膜病变等方面有独到的经验和诊治技术。该科室可以发现常规检查不能及时发现的早产儿视网膜病变及家族性遗传性眼病等，能够及时判断新生儿眼部健康状况，对眼部病变做到及早发现，及早治疗。
第八名：深圳市罗湖区人民医院-眼科
深圳市罗湖区人民医院眼科，是集医疗、教学、科研为一体的临床科室。可开展白内障、青光眼、眼外伤、眼底病、眼表、整形、斜弱视、泪器等各种眼科手术，尤其在复杂白内障手术、功能型人工晶体植入、ICL（有晶体眼后房型人工晶体）植入术。玻璃体视网膜手术方面具有较强的实力。
第九名：深圳市宝安区人民医院-眼科
深圳市宝安区人民医院的眼科，已成为深圳市西部地区技术力量最为雄厚的眼科专科，服务于深圳市宝安区及周边地区六百多万人口，并在该区率先开展白内障超声乳化摘除术+人工晶体植入术，现已使7千余名白内障患者带来光明。近年来科室承担或参与完成省市级科研课题5项，在国家核心期刊上发表或参与学术论文近二十篇。