蚌埠呼吸科好的医院是蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院、蚌埠医学院第二附属医院、蚌埠市第三人民医院等。蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院呼吸与危重症医学科是国家临床重点专科，引领了介入呼吸病专业的跨越式发展；蚌埠医学院第二附属医院呼吸内科在呼吸系统的疾病诊断治疗上，有着突出的成绩；蚌埠市第三人民医院呼吸内科是较早独立建制的呼吸病专科，是十二五“蚌埠市临床医学重点学科。
第一名：蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院-呼吸与危重症医学科
蚌埠市蚌埠医学院第一附属医院呼吸与危重症医学科是国家临床重点专科、国家呼吸病临床研究中心核心单位。科室在省内率先开展肺癌的分子诊断工作，为肺癌的精准治疗提供支撑，其学术地位和诊断水平，居于国内先进、省内领先地位。能够独立开展全部三、四级呼吸内镜诊疗技术，引领了安徽省介入呼吸病专业的跨越式发展。
第二名：蚌埠医学院第二附属医院-呼吸内科
蚌埠医学院第二附属医院呼吸内科在呼吸系统的常见病、多发病、疑难重病的诊断治疗上，有着突出的成绩。常规开展结合菌素纯蛋白衍生物试验、电子支气管镜检查等诊疗技术。开展的具有特色的诊疗项目有支气管肺泡灌洗、支气管镜下活检、经支气管镜细针穿刺肺活检和淋巴结活检、经皮肺穿刺活检术诊断肺外周占位性病变、胸腔闭式引流等。
第三名：蚌埠市第三人民医院-呼吸内科
蚌埠市第三人民医院呼吸内科是较早独立建制的呼吸病专科，是十二五“蚌埠市临床医学重点学科，也是安徽省呼吸专科联盟常务理事单位，在蚌埠市具有较高的学术地位及影响力。能熟练开展2012年安徽省呼吸专业三甲技术项目，目前开展的项目有支气管镜穿刺淋巴结活检术、支气管镜下冷热消融治疗支气管良恶性狭窄性病变、内科胸腔镜技术、CT引导下肺恶性肿瘤消融治疗，属省内先进、市内领先水平。
第四名：蚌埠市第一人民医院-呼吸内科
蚌埠市第一人民医院呼吸内科系市重点学科。设有专家门诊、普通门诊、睡眠障碍专病门诊、肺癌门诊等，能诊治的疾病主要有慢性阻塞性肺疾病、社区获得性肺炎、急性支气管炎、支气管扩张、支气管哮、结节病等。已开展的技术有纤维支气管镜检查技术、经纤支镜插管术、经皮穿刺肺活检技术、无创（有创）机械通气术、经支气管镜介入诊疗术等。
第五名：蚌埠市第二人民医院-呼吸内科
蚌埠市第二人民医院呼吸内科为国家PCCM规范化建设项二级医院优秀科室，为医院的重点学科。对呼吸系统常见病如慢性阻塞性肺疾病、肺动脉高压、肺心病、支气管哮喘、肺癌、肺部感染、呼吸衰竭、间质性肺疾病、不明原因胸腔积液、肺栓塞、咯血等有较为成熟和规范化的诊断和治疗方案，对危重患者的抢救有丰富的临床经验。