江苏消化内科比较厉害的三个医院是南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院。
南京医科大学第一附属医院消化内科是国家临床重点专科，中国医科院科技量值全国第8，内镜技术与早癌诊治国内领先。南京鼓楼医院消化内科历史悠久，复旦专科榜全国第15（江苏唯一入围），微创诊疗技术国内前沿。东南大学附属中大医院消化内科是省临床重点专科，规模居全省前列，内镜诊疗水平达国内先进。
1、南京医科大学第一附属医院 消化内科
创建于1959年，是国家临床重点专科、教育部国家重点学科培育点，卫生部消化专科医师及内镜诊疗培训基地示范点。2019年中国医科院科技量值全国第8，设7个亚专科，擅长消化道早癌筛查诊治、消化道瘘封堵、胆胰疾病内镜治疗等。自主发明消化道瘘封堵器并获多国专利，率先开展肠道菌群活性代谢检测，科研实力强劲。
承担多项国家自然基金，获中华医学科技奖等多项荣誉。
2、南京鼓楼医院 消化内科
始建于1953年，是国家临床重点专科、省消化内镜诊疗中心，2020年复旦版专科声誉榜全国第15（江苏唯一入围）。消化内镜中心为全国最早成立的内镜中心之一，创办《中华消化内镜杂志》。擅长胆胰疾病、消化道早癌、消化重症等诊治，多项微创技术国内首创或领先。
学科带头人邹晓平、王雷教授学术造诣深厚，主持多项国家级课题，获国家科技进步二等奖等多项奖励。
3、东南大学附属中大医院 消化内科
江苏省规模最大的省级临床重点专科，中国消化内镜学院培训基地，内镜设备国内领先。核心擅长消化道早癌ESD治疗、贲门失弛缓症POEM治疗、食管胃底静脉曲张内镜治疗等，尤其食管和胃早癌ESD技术居国内领先地位。多次承办国家级、省级学术会议，培训近万人次，承担多项国家及省部级课题，获省市级科技进步奖，综合诊疗水平达国内先进。
4、苏州大学附属第一医院 消化内科
成立于1972年，省临床重点专科，苏大内科消化专业博硕士授予点。诊疗设备先进，擅长胆胰疾病内镜治疗、消化道息肉及黏膜下肿瘤内镜诊治、食管胃底静脉曲张内镜治疗等，形成鲜明技术优势。近年来发表多篇核心及SCI论文，承担国家自然基金及多项省市级课题，多次获省卫生厅新技术引进奖，兼具扎实的医疗、教学与科研实力，区域影响力突出。
5、东部战区总医院 消化内科
拥有60多年历史，创建于1946年，是南京军区消化病中心、全国及全军临床药理基地，多所高校博硕士授予点及博士后流动站。擅长各类消化系统疾病诊治，内镜下EMR、ESD技术成熟，肝硬化并发症诊治成效显著，ERCP、EUS等内镜治疗达国内先进水平。主攻消化道肿瘤早期诊治、慢性溃疡性结肠炎研究，承担多项省部级重点课题，获国家发明专利及多项科研成果。
