潍坊市中医院擅长针灸科、脾胃病科、脑病科、骨伤科、肿瘤科。上述科室具有先进的治疗水平，能够为患者提供可靠的诊疗基础和保障。
1、针灸科
是山东省重点专科、潍坊市重点专科，也是全市最大的针灸推拿医疗、教学、科研中心。科室坚持走中医特色之路，结合现代科技手段，开展了穴位注射、穴位埋线、小针刀等治疗项目，对适应病症及疑难杂症达到了标本兼治的目的，取得了较好的疗效和社会美誉度。
2、脾胃病科
是山东省重点专科、潍坊市重点专科，在诊断和治疗胃痛、腹痛、呕吐、呕血、积聚、泄泻、久痢、胁痛、便秘等疾病方面积累了丰富的临床经验，取得了满意的疗效。
3、脑病科
科室设有省内规模最大的脑病康复中心，在治疗眩晕、癫痫、帕金森、周围血管、失眠等疾病方面形成了特色优势，在中西医结合诊治老年痴呆病研究方面达到国内先进水平。
4、骨伤科
是山东省中医界建立最早的骨伤科，被评为国家临床重点专科，科室能够成熟应用腔镜技术，其中运用关节内窥镜微创治疗膝关节、肩关节等疾病形成了明显的地区优势，同时 植骨疗法治疗股骨头缺血性坏死等技术方面达到国内领先水平。
5、肿瘤科
是国家“十三五”重点专科、全国中医肿瘤中心合作单位、潍坊市重点专科，科室对患者开展中西医结合治疗，形成了特色优势，并且在中西医结合治疗血液病方面填补了潍坊地区的空白。
