厦门肛肠科医院排名靠前的是厦门大学附属中山医院普通外科、厦门医学院附属第二医院肛肠外科、中国人民解放军第一七四医院普外科等。厦门大学附属中山医院普通外科是国家重点专科，在厦门乃至闽南地区享有较高声誉，多项腔镜诊疗技术处于国内外领先水平；厦门医学院附属第二医院肛肠外科以中西医结合为诊疗特色，在厦门市率先开展肛肠微创手术，盆底外科多项技术为福建省首创；中国人民解放军第一七四医院普外科拥有60余年发展历史，是医院重点学科，消化道肿瘤外科治疗等特色项目辐射闽南地区。
1、厦门大学附属中山医院 普通外科
该科室是国家重点专科，在厦门乃至整个闽南地区享有较高声誉，在省内、闽南地区率先开展多项新技术，可独立完成卫生部颁布的三甲医院全部普外科手术。该科室多项技术处于国内外领先梯队，包括经口底入路腔镜甲状腺切除术为国内第一、亚洲第一、世界第二开展，完成世界首例经胸经口联合入路腔镜甲状腺癌颈侧区淋巴结清扫，率先开展亚洲及国内首例经颏下口腔前庭入路腔镜甲状腺手术等；完成闽西南首台达芬奇Xi机器人甲状腺手术，国内首次开展免充气经口入路达芬奇机器人甲状腺手术。在肛肠相关疾病诊疗上，该科室腹腔镜下胃癌、结肠癌根治术、低位直肠癌保肛手术、各类疝修补术等微创手术娴熟，是福建省率先开展腹腔镜下减重手术的科室。专科门急诊月均就诊3500余人次，月均入院400余人次，近年获市科技局科研立项3项，发表各级专业论著数十篇，参与编著多项甲状腺疾病相关共识与专著。
2、厦门医学院附属第二医院 肛肠外科
该科室以现代化中西医结合为诊疗特色，传承优化传统治疗技术的同时吸收国际国内先进诊疗理念，近年大力推行ERAS理念，以微创、无痛、标准化、规范化的要求严格开展诊疗工作。该科室在厦门市率先开展肛肠微创手术，手术具备创伤小、疼痛轻、愈合快、预后好的特点，解决了多数患者因畏惧疼痛延缓治疗的问题；在福建省率先开展盆底手术，手术解剖精细、技术难度高。该科室应用注射疗法、PPH、TST、RPH、STARR等技术治疗痔病及直肠黏膜脱垂处于省内领先水平，可开展国际最新的多种肛瘘术式，尤其肛管括约肌重建、直肠阴道瘘修补、直肠脱垂悬吊固定等盆底外科手术为福建省首创，达到国内先进水平，保肛保功能治疗效果卓越，曾收治省内外多次手术失败的复杂性、复发性肛瘘患者，手术成功率高。
3、中国人民解放军第一七四医院 普外科
该科室是医院重点学科，拥有60余年发展历史，在危重病人抢救及疑难病人诊疗方面积累了丰富经验。该科室常规开展所有普外科疾病的手术及治疗，在危重及创伤病人救治上规范高效，抢救成功率高；胃癌、结直肠癌的开放及腹腔镜手术操作规范、根治彻底，采用标准化精准手术模式，患者无瘤生存率高、复发率低。该科室腔镜手术成熟普及，形成了消化道肿瘤外科治疗、直肠PPH手术等特色医疗项目，吸引了众多闽南地区患者就诊。该科室年门诊量达2万人次，年收治患者1500余人次，年手术例数1000余例；先后获国家重点实验室基金、南京军区科研重点课题等多项课题资助，在包括SCI收录的国内外期刊发表论文50余篇，获全军科技进步三等奖等多个奖项，与国内外医学中心广泛交流，省内知名度逐年提升。
4、厦门市第三医院 肛肠科
该科室深耕肛肠科疾病诊疗领域，对肛肠科常见病、多发病、疑难病的诊治经验成熟，尤其在肛周疾病诊疗方面具有显著优势。该科室诊疗覆盖的肛周疾病种类全面，包括内痔、外痔、混合痔等各类痔病，以及肛裂、肛瘘、肛周脓肿、肛窦炎、肛乳头炎、肛乳头瘤、肛门瘙痒症、肛周皮肤病等，可针对不同病情的患者制定适配的诊疗方案，切实解决患者的肛肠疾病困扰，为辖区居民提供专业可靠的肛肠诊疗服务。
5、厦门思明医院 肛肠科
该科室有近50年的发展历史，是厦门市成立较早的痔疮专科之一，以中西医结合为核心诊疗基础，采用手术治疗联合中医膏剂、散剂、熏洗剂的综合方案，在内外痔、肛瘘、肛裂及肛周疾病治疗方面有独到之处。该科室的传统特色膏剂包括消炎膏、生肌膏、湿疹膏等，经长期临床验证，对痔疮、肛周湿疹等疾病疗效确切。除传统手术外，该科室还运用红外线治疗仪开展多种肛周疾病的深层次治疗，针对慢性结肠炎、溃疡性结肠炎、肠易激综合征有独到的中西医结合疗法，疗效较为满意；同时可开展便秘的分类诊断及出口梗阻型便秘的手术治疗，能满足不同类型肛肠疾病患者的诊疗需求。
