儿童泌尿外科比较好的医院是首都医科大学附属北京儿童医院、复旦大学附属儿科医院、重庆医科大学附属儿童医院，首都医科大学附属北京儿童医院泌尿外科是国内最早的小儿泌尿外科专业，在各种小儿泌尿生殖系疾病的诊断和治疗方面达到了国内领先、国际先进水平。复旦大学附属儿科医院泌尿外科在国内率先开展微创伤手术和腔内手术；重庆医科大学附属儿童医院泌尿外科是国内最早成立的小儿泌尿生殖外科专业组之一。
第一名：首都医科大学附属北京儿童医院-泌尿外科
首都医科大学附属北京儿童医院泌尿外科由国内小儿泌尿外科创始人黄澄如教授组建，是国内最早的小儿泌尿外科专业。科室在各种小儿泌尿生殖系疾病的诊断和治疗方面达到了国内领先、国际先进水平。学科还主编出版了国内第一部小儿泌尿外科专著《小儿泌尿外科学》。
第二名：复旦大学附属儿科医院-泌尿外科
复旦大学附属儿科医院泌尿外科在先天性肾脏输尿管畸形、尿道下裂等常见病的诊治；肾脏、膀胱及前列腺肿瘤的手术治疗；膀胱外翻、神经原性膀胱等严重、少见畸形纠治、泌尿系统结石诊治等方面均已达到国内先进水平。在国内率先开展微创伤手术和腔内手术。开展了经脐单切口腹腔镜手术，达到国际先进水平。
第三名：重庆医科大学附属儿童医院-泌尿外科
重庆医科大学附属儿童医院泌尿外科是国内最早成立的小儿泌尿生殖外科专业组之一，是重庆市医学重点学科。科室拥有多名儿童泌尿外科全国知名专家，具有丰富临床经验，疾病诊治及护理水平达到国内先进或领先。学科在临床应用转化、基础研究等方面的综合实力已位居全国领先水平。
第四名：广州市妇女儿童医疗中心-泌尿外科
广州市妇女儿童医疗中心泌尿外科，目前是华南最大的小儿泌尿外科诊治中心，年收治病例数位于华南地区首位，水平已跻身国内领先。现已称为一个医疗设备和技术先进、齐全，以治疗病种覆盖全部泌尿系统外科疾病（肾、输尿管、膀胱、尿道、阴茎）的特色学科。
第五名：浙江大学医学院附属儿童医院-泌尿外科
浙江大学医学院附属儿童医院泌尿外科为全国最大的小儿泌尿外科疾病诊治中心之一。率先在国内应用小儿膀胱镜、尿道镜、腹腔镜微创无创技术作为手术辅助手段开展一系列工作。常规开展各年龄阶段儿童泌尿外科手术，以尿道下裂修复、隐匿性阴茎整形为主要特色，均达到国内领先水平。
第六名：中国医科大学附属盛京医院-小儿泌尿外科
中国医科大学附属盛京医院小儿泌尿外科是国内成立较早且为数不多的独立科室，其医疗水平在国内处于先进地位。专业技术力量雄厚，收治病人以小儿泌尿生殖系畸形、肿瘤为主，开展了微创手术治疗肾积水、重复肾畸形、肾囊等疾病。对神经性膀胱等排尿功能障碍性疾病也有丰富的治疗经验。
第七名：上海交通大学医学院附属新华医院-小儿泌尿外科
上海交通大学医学院附属新华医院小儿泌尿外科，是泌尿外科中最先发展起来的亚专业之一，是国家小儿泌尿结石诊疗中心。科室在小儿泌尿系肿瘤，尤其是巨大、复杂肿瘤的手术治疗方面，术后5年生存率处于国内领先水平。在国内率先开展了Lich-Gregoir治疗儿童原发性膀胱输尿管返流等手术方式，其手术病例数及治疗效果等均在国内处于领先地位。
第八名：上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心-普外科
上海儿童医学中心儿外科是上海市重点学科，是国内儿童疑难杂症的诊治中心之一，下设小儿肿瘤外科、小儿微创外科、小儿整形外科、新生儿外科和血管外科等亚专科。肿瘤外科全国较早在国内开展肿瘤多学科协作治疗模式，儿童实体肿瘤远期疗效接近国际先进水准；小儿微创外科领域涉及小儿普外科、心胸外科、泌尿外科、骨科、神经外科等，取得了良好的声誉；小儿整形外科开展了早期婴幼儿唇裂、腭裂、面部畸形的手术整形，取得了良好的疗效及社会口碑；新生儿外科依托新生儿病房是上海市危重新生儿抢救中心。
第九名：首都儿科研究所附属儿童医院-泌尿外科
首都儿科研究所附属儿童医院泌尿外科在国内小儿泌尿外科创始人黄澄如教授的带领下组建，是国内最早的小儿泌尿外科专业。技术力量雄厚，各种小儿泌尿生殖系疾病的诊断和治疗达到国内领先、国际先进水平。特别是肾盂输尿管交接部断裂的诊治达国际领先水平。
第十名：四川大学华西医院-小儿泌尿科
四川大学华西医院小儿泌尿科先后开创了尿道成形近侧不转流技术、带蒂皮瓣尿道成形术、多层组织瓣交错覆盖技术、纵行带蒂包皮瓣尿道成形术、改良Koyanagi-Huang尿道成形术，治疗效果好，技术在国内广泛推广。在国内率先开展儿童达芬奇机器人辅助的腹腔镜微创手术，目前开展的众多技术在国内处于领先水平。科室擅长治疗各种类型尿道下裂，治疗水平达到国际水平、国内领先。