广州市脑科医院擅长神经内科、中医科、临床心理科、老年科、儿少科。上述科室学科综合实力领先，临床专科诊治优势突出，能够为患者提供优质的医疗服务。
1、神经内科
是国内精神病医院极少拥有的神经科专科，一直担负着器质性与功能性精神病的鉴别诊治以及危重症的救治的重任。致力于脑血管病、脑膜炎、癫痫、头痛等疾病的诊治和研究，对于这些疾病所导致的肢体功能、智力、记忆和语言功能下降、以及伴发的情绪和精神异常的康复有成熟的经验。
2、中医科
是广州市中医名科中西医结合郁病专科建设单位、广州市中医药工作示范单位。开展了子午流注穴位刺激治疗、拔罐、刮痧、中医五行音乐治疗、中药沐足、耳穴压豆、微波针等中医传统治疗，擅长中西医结合治疗睡眠障碍、焦虑、抑郁、体质调理等。
3、临床心理科
是国内较早开展心理咨询、心理治疗、心理测量、心理社会干预及心理健康教育及研究的精神病专科医院亚专科。主要开展心理测评、心理咨询及治疗及心理健康教育等内容，不断扩大内涵建设，到目前在心理咨询与治疗门诊、心理病房建设及心理干预技术手段等方面都取得重大的发展。
4、老年科
是国内最早成立的老年精神科亚专科之一，专业为年届60岁以上长者提供老人精神疾病评估、治疗及康复服务。擅长老人精神障碍，如痴呆伴发的精神行为障碍、老年期抑郁障碍、双相情感障碍、躯体疾病所致精神障碍、睡眠障碍等的诊治。
5、儿少科
是广东省最早的儿童精神科，长期承担广州医科大学和中山大学等多个高校的临床教学和实习培养。在常规提供药物治疗、物理治疗和心理治疗的基础上，整理出了一套行之有效的整合干预模式，形成了具有鲜明特色的临床整合干预项目，积累了丰富的临床经验。
