济南脑科医院有山东大学齐鲁医院、山东省立医院、山东第一医科大学第一附属医院等。山东大学齐鲁医院神经内科是山东省神经病学专业的发源地，是国内神经病学界历史最悠久的医疗教学和科研单位之一。山东省立医院神经内科是山东省临床重点专科、山东大学“十一五”重点学科。山东第一医科大学第一附属医院神经内科是国家级高级卒中中心，国家中医脑病临床重点专科。
第一名：山东大学齐鲁医院-神经内科
山东大学齐鲁医院神经内科是山东省神经病学专业的发源地，是国内神经病学界历史最悠久的医疗教学和科研单位之一。下设癫痫与脑电生理专业组、神经肌肉病及遗传代谢病专业组、脑血管病专业组、帕金森病与运动障碍疾病专业组、神经感染与免疫专业组、认知障碍专业组、身心医学专业组、头痛与头晕专业组等多个各具特色的临床亚专业。癫痫与脑电生理专业组是齐鲁医院神经内科具有特色优势的专科方向之一，是国内最早开展癫痫病学研究的单位之一。
第二名：山东省立医院-神经内科
山东省立医院神经内科是山东省临床重点专科、山东大学“十一五”重点学科、山东省医药卫生重点实验室。学科已形成了脑血管病介入诊疗、神经变性疾病与遗传病、神经免疫病与神经系统感染、癫痫与发作疾病等4个特色鲜明、优势明显的亚专业，近3年内开展了新技术12项，极大增强了处理复杂、疑难危重疾病的诊疗能力，在国家临床重点专科评比中，科室实力在国内排名为第一梯队。
第三名：山东第一医科大学第一附属医院-神经内科
山东第一医科大学第一附属医院神经内科是国家级高级卒中中心，国家中医脑病临床重点专科、山东省医药卫生重点学科、山东省临床重点专科、山东省神经免疫临床精品特色专科。科室在各类复杂颅内外动脉狭窄血管成形术、慢性脑动脉闭塞介入再通术、急性脑卒中介入取栓术和颅内动脉瘤介入栓塞术等领域的神经介入治疗数量、质量及安全性均处于国内一流水平。脑血管病、癫痫等的专业诊治位于国内领先水平。
第四名：山东大学第二医院-神经内科
山东大学第二医院神经内科2004年被评为卫生部临床药理基地。2010年被评为“山东省医疗质量示范科室”，同年获批成立“山东省医药卫生重点学科”。设有神经心理和痴呆亚专业组、脑血管病亚专业组、癫痫和睡眠障碍亚专业组、神经免疫与感染亚专业组、神经重症亚专业组等。在神经病学领域处于国内先进水平。在神经心理和痴呆亚专业特别是阿尔茨海默病的临床和科研方面形成一定优势，在国内具有较大影响。
第五名：济南市中心医院-神经内科
济南市中心医院神经内科，是国家级高级卒中中心、国家卫计委脑卒中筛查和防治基地，山东省临床重点专科，山东省及济南市医药卫生重点专业，山东省脑卒中绿色通道，济南市卒中中心，济南市神经内科专业质量控制中心，济南市卒中中心质控单位。对脑卒中综合救治能力名列全市前茅，在老年性痴呆、帕金森病的基础与临床研究及综合诊治、癫痫的诊断治疗及药代动力学研究、神经肌肉病及遗传代谢病的诊治方面处于全市领先水平。