南通儿科医院排名靠前的是南通大学附属医院小儿内科、南通市第一人民医院儿科、南通市妇幼保健院儿内科等。南通大学附属医院小儿内科创建于1951年，是江苏省临床重点专科，建有“急诊-留观-PICU”危急重症救治体系，年救治危急重症患儿近千例，配备小儿电子支气管镜、血液净化机等先进设备。南通市第一人民医院儿科分为儿内科、儿外科两个亚科室，儿内科是江苏省临床重点专科、江苏省新生儿危急重症救治中心，儿外科为南通市临床重点专科。南通市妇幼保健院儿内科新生儿科是江苏省妇幼保健重点学科、首批省级新生儿危急重症救治中心，危重症新生儿抢救成功率达95%以上。
1、南通大学附属医院 小儿内科
该科室创建于1951年，是江苏省临床重点专科，具有硕士学位授予权，是南通地区儿科医师进修、研究生培养、住院医师规范化培训的基地。科室现有江苏省医学会儿科学会各专业组委员11人、南通市医学会儿科学会主任委员1名，下设10个亚专业组及对应专科门诊，建有“急诊-留观-PICU”危急重症救治体系，年救治危急重症患儿近千例，配备小儿电子支气管镜、血液净化机等先进设备。近年承担国家自然科学基金2项，省厅、市级课题40余项，发表SCI收录论文20篇，出版主编或副主编专著2部。
2、南通市第一人民医院 儿科
该科室分为儿内科、儿外科两个亚科室，其中儿内科是江苏省临床重点专科、江苏省新生儿危急重症救治中心、国家级住院医师规范化培训基地、国家级儿童哮喘标准化门诊，也是南通市“十四五”医学重点学科建设单位；儿外科2020年成立，为南通市临床重点专科。科室多人获评南通市“226”人才、“十四五”科教兴卫重点人才等称号，多人在各级学会任职。科室可开展超未出生体重儿诊治、支气管镜治疗、小儿腹腔镜微创手术等技术，儿童骨科微创治疗比例达90%以上，居南通地区前列。近三年承担省级课题4项、市级课题20项，发表SCI论文16篇，获发明专利6项。
3、南通市妇幼保健院 儿内科
该科室下设新生儿、呼吸、消化、心血管、儿童重症监护室、中医儿科等多个亚专业。其中新生儿科是江苏省妇幼保健重点学科、首批省级新生儿危急重症救治中心，危重症抢救成功率95%以上，与南通120联动开通24小时全市危重患儿转运绿色通道，2018年成立南通首家母乳库中心，成功抢救胎龄24+5周双胎儿，达省内领先水平。小儿心内科与上海复旦大学附属儿科医院联合开展先心介入手术，为本地患儿省去辗转就医的麻烦，近年立项含国家自然科学基金在内的各级课题10余项。
4、南通市通州区人民医院 儿科
该科室是全区儿科疾病防治中心、危重新生儿救治中心，开设儿保门诊、矮小门诊、哮喘门诊、小儿心理咨询等特色门诊，可满足不同患儿的差异化诊疗需求，具备解决小儿疑难病症及危重患儿抢救的能力。近3年获市级科研立项2项、区级1项，曾被江苏省卫生厅评为青年文明号。
5、海安市人民医院 儿科
该科室成立于1980年，2011年获评南通市临床重点专科，2012年获评南通市医学重点学科，同年开设无陪新生儿病区，2017年首批通过江苏省县级危重新生儿救治中心验收，系国家级母婴友好医院。科室设有3个普儿病区、1个新生儿病区，设置床位130张，承担多所高等院校的教学任务以及住院医师规范化培训工作，可处理儿内科各种常见病、多发病，对疑难杂症诊治积累了丰富经验，业务覆盖海安及周边地区，拥有生长发育门诊、哮喘规范化治疗、无陪新生儿病房等6项特色诊疗项目，承担多项市级科研课题。
