上海肿瘤科医院排名第一的是复旦大学附属肿瘤医院，该医院的肿瘤内科是国家教育部重点学科、国家临床重点专科，同时拥有上海市乳腺肿瘤重点实验室、上海市放射肿瘤学重点实验室等。上海肿瘤科医院好的还有上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学附属中山医院，其肿瘤科分别为国家临床重点专科和国家卫生部临床重点学科。
第一名：复旦大学附属肿瘤医院-肿瘤内科
复旦大学附属肿瘤医院的肿瘤内科是国家教育部重点学科、国家临床重点专科、上海市临床医学中心、上海市临床重点专科项目。医院拥有上海市乳腺肿瘤重点实验室、上海市放射肿瘤学重点实验室、上海市肿瘤疾病人工智能工程技术研究中心、上海市胰腺肿瘤研究所和上海市泌尿肿瘤研究所，以及复旦大学肿瘤研究所、复旦大学胸部肿瘤研究所等科研机构，成立王红阳院士工作站，建有复旦大学附属肿瘤医院精准肿瘤中心，继续推进国家疑难病症诊治能力提升工程项目。
第二名：上海交通大学医学院附属瑞金医院-肿瘤科
上海交通大学医学院附属瑞金医院肿瘤科是国家临床重点专科、FDA批准的肿瘤新药临床试验基地、首批上海市癌痛规范化病房，以胃肠、乳腺、胰腺等我国高发实体瘤的化学治疗、靶向治疗、新药临床研究为特色。科室现有病床81张(肿瘤科一二病区、乳腺肿瘤内科)，每年收治肿瘤患者人次逾万，5大优势特色病种（胃癌、结直肠癌、乳腺癌、食管癌、胆胰肿瘤）占85%以上。紧密依托胃肠肿瘤、乳腺肿瘤、胰腺肿瘤等医院传统优势病种，定期开设或参与胃癌、结直肠癌、乳腺癌、胰腺癌等10个肿瘤MDT门诊，长效常态运转、制定全程管理、合理布局的标准化规范流程。
第三名：复旦大学附属中山医院-肿瘤内科
复旦大学附属中山医院肿瘤学下设肝肿瘤内科、肝肿瘤外科、妇科肿瘤科、肿瘤内科四个科室，其中肿瘤内科2013年建设成为国家卫生部临床重点学科；肝肿瘤内科已经成为国家级肿瘤学重点学科、上海市肝脏肿瘤临床医学中心、卫生部临床重点学科、复旦大学“重中之重”建设学科及“985”、“211”建设项目肿瘤学重点专科、中国抗癌协会肝癌专业委员会依托单位、国家药品监督管理局中山医院临床药理基地单位、牵头制定卫生部“原发性肝癌诊疗规范”；肝外科为全国肿瘤学重点学科、中国抗癌协会肝癌专业委员会依托单位、癌变与侵袭原理教育部重点实验室、卫生部临床重点学科、上海市肝肿瘤临床医学中心（重中之重）、上海市医学领先学科肝脏肿瘤学重点学科。
第四名：复旦大学附属华山医院-肿瘤科
复旦大学附属华山医院肿瘤科为国家临床重点专科建设项目，在医、教、研等方面均取得巨大成绩。常规开展下列多种实体肿瘤的诊断、化疗、生物靶向治疗及肿瘤微创治疗，取得良好的诊疗效果。其诊治病种包括脑转移瘤、肺癌、乳腺癌、脑胶质瘤、胃癌、肠癌、食管癌等。
第五名：上海交通大学医学院附属仁济医院-肿瘤科
上海交通大学医学院附属仁济医院肿瘤科是上海市临床重点专科、上海市“重中之重”临床医学中心、上海市教委肿瘤学重点学科。《2018年度中国医院科技量值评价（肿瘤学）》，综合性医院中列第5位，在全国率先成立MDT专家委员会，建立了上海最大的肿瘤日间化疗中心。
第六名：上海交通大学医学院附属第九人民医院-肿瘤科
上海交通大学医学院附属第九人民医院肿瘤科拥有目前世界上先进的放射治疗设备、影像检查等设备，开展三维适形放射治疗及调强放射治疗等先进技术，并开设肿瘤多学科联合诊治门诊，为肿瘤患者提供最科学的诊断治疗技术和最优质的一站式服务。个体化治疗是该科室的最大特色。
第七名：上海市第六人民医院-肿瘤内科
上海第六人民医院肿瘤内科是上海市第六人民医院重点发展的临床学科。拥有多种治疗特色，主要擅长于实体肿瘤的诊断、内科综合治疗。各部位骨转移癌的外科手术治疗、同位素内照射治疗技术等在国内处于领先地位；骨转移癌患者血清标记物的检测填补了国内空白。
第八名：上海长海医院-肿瘤科
上海长海医院肿瘤科在诊治方面积累了丰富的临床经验，已逐渐成为集肿瘤化疗、放疗、生物免疫、靶向治疗等于一体的综合性科室。积极开展现代肿瘤内科治疗新技术，对恶性乳腺癌、肝癌、淋巴瘤、肺癌、胃癌、结直肠癌、软组织肉瘤，睾丸肿瘤等恶性肿瘤的治疗达国内先进水平。
第九名：上海交通大学医学院附属新华医院-肿瘤科
上海交通大学医学院附属新华医院肿瘤科是上海市最早成立的综合医院肿瘤科之一。拥有上海市首台和唯一引进的TOMOHD肿瘤放射治疗高端设备，擅长各种实体肿瘤的诊断及综合治疗，拥有多种治疗设备和手段，包括化疗、靶向治疗、放疗、聚焦超声、介入治疗、内窥镜下治疗、化疗增敏等，形成全方位的肿瘤治疗体系。
第十名：上海市第一人民医院-肿瘤科
上海市第一人民医院肿瘤科是国家临床重点专科、中国抗癌协会临床肿瘤学会(CSCO)执行安员会单位、上海市肿瘤化疗质控中心专家委员单位。下设肿瘤内科、肿瘤放疗科、肿瘤介入科等亚专科，主持/参与乳腺癌、肺癌、结直肠癌、胰腺癌、胃癌等国际、国内多中心临床研究数十项。