南京胸外科医院排名比较靠前的是南京市胸科医院、南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院。
南京市胸科医院胸心外科是南京市重点专科，单孔胸腔镜技术国内领先。南京医科大学第一附属医院胸外科是省临床重点专科，微创肺段与食管癌治疗国内先进。南京鼓楼医院心胸外科为国家区域医疗中心，心脏大血管手术实力省内第一。
1.南京市胸科医院 胸心外科
南京市胸科医院胸心外科是南京市重点专科，胸腔镜微创技术华东地区领先，省内率先开展剑突下单孔胸腔镜手术，肺移植、纵隔镜技术填补地区空白。擅长肺癌、肺小结节精准微创治疗，单孔胸腔镜肺叶、肺段及支气管成形术水平突出，纵隔疾病诊断准确率高。承担多项科研课题，获省市科技进步奖及新技术引进奖近20项，学术成果丰硕。
2.南京医科大学第一附属医院 胸外科
南京医科大学第一附属医院胸外科是江苏省临床重点专科，博士点及博士后流动站科室。微创肺叶、精准肺段切除及3D成像导航技术国内领先，完成世界首例混合现实技术辅助肺肿瘤切除术。食管癌微创及淋巴结清扫技术成熟，获省级新技术一等奖。国内率先建立无痛与加速康复病房，承担多项省部级课题，出版多部专业专著。
3.南京鼓楼医院 心胸外科
南京鼓楼医院心胸外科是国家心血管区域医疗中心建设单位，江苏省大血管疾病诊疗中心，复旦专科声誉榜省内第一。创建右腋下微创小切口术式享誉全国，主动脉夹层6小时生命圈技术突出，TAVI、全胸腹主动脉置换、自体心脏移植等技术国内领先。科室获中华医学科技奖等多项奖励，科研平台与专利成果丰富。
4.东南大学附属中大医院 胸心外科
东南大学附属中大医院胸心外科在胸心手术，微创冠脉搭桥、全动脉化冠脉搭桥技术省内领先。常规开展各类肺癌、食管癌、瓣膜病、先心病及大血管手术，胸腔镜微创治疗气胸、肺气肿等项目省内前列。独创食管吻合技术，并发症少、恢复快。承担多项省厅级课题，获科技进步奖5项，培养研究生28名。
5.东部战区总医院 心胸外科
东部战区总医院心胸外科是江苏省135工程重点学科、南京军区心血管病研究所外科部，博硕士研究生培养单位。在重症心脏瓣膜置换、冠脉搭桥、大血管疾病、复杂先心病矫治、肺食管纵隔肿瘤手术方面实力突出，机器人及胸腔镜微创外科、危重急症救治在军内外享有盛誉，学科底蕴深厚、技术全面。
