深圳小儿心内科医院排名比较靠前的是深圳市儿童医院、深圳市人民医院、北京大学深圳医院。
深圳市儿童医院心血管内科是深圳市最大的儿童心血管诊治中心，多项复杂先心病介入技术填补深圳市空白并在华南地区领先。深圳市人民医院儿内科是深圳市创建最早的儿童专科，病房专门设立小儿心血管专业组，采用先进电生理方法研究小儿心律失常，并运用超声影像学技术监测川崎病患儿冠状动脉变化。北京大学深圳医院儿科是业务范围明确涵盖小儿心血管等各专业疾病的诊断与治疗。
1.深圳市儿童医院 心血管内科
深圳市儿童医院心血管内科是深圳市最大的儿童心血管诊治中心及国家儿童医学中心心血管专科联盟成员单位。引进广东省心血管研究所张智伟教授三名工程团队，多项儿童复杂先心病微创介入技术填补深圳市空白达华南地区领先。完成出生后一天新生儿重度肺动脉瓣狭窄球囊扩张术等技术难度国内领先，完成深圳首例儿童ICD植入及国内最低体重患儿ICD植入。在国际上首次提出使用中药小檗碱治疗川崎病降低无反应发生率。
2.深圳市人民医院 儿内科
深圳市人民医院儿内科是深圳市创建最早的儿童专科，其新生儿科为广东省重点专科及省新生儿危重症救治中心。病房专门设立小儿心血管等专业组，各专科人员配备齐全且设备先进。科室常年开设由经验丰富专家坐诊的心血管专病门诊，不仅开展小儿川崎病、小儿心肌炎等现代治疗，更运用先进电生理方法研究小儿心律失常，并采用超声影像学技术监测川崎病患儿冠状动脉变化，在小儿心血管疑难疾病诊治上积累极其丰厚底蕴。
3.北京大学深圳医院 儿科
北京大学深圳医院儿科是高水平医院重点建设科室，拥有中国医师协会儿童重症医师分会常务委员等国家级学术任职专家及美国AHA儿科生命支持培训导师。业务范围明确涵盖小儿心血管等各专业疾病的诊断与治疗。作为国家住院医师规范化培训儿科专业培训基地，科室配备小儿纤支镜系统、无创血流动力学监测仪等先进医疗设备，在疑难危重症救治上实力强劲。
4.深圳市第二人民医院 儿科
深圳市第二人民医院儿科是医院重点学科，在儿童神经修复治疗及地中海贫血规范化输血去铁治疗和管理方面处于国内先进水平。科室引进复旦大学附属儿科医院王艺教授儿童神经康复三名工程团队，建设区域性儿童神经发育障碍诊治康复中心。业务涵盖心血管、遗传代谢病及疑难危急重症等领域，在基因治疗儿童遗传性脑白质营养不良及体外反搏治疗难治性癫痫等方面开展深入临床研究。
