中国人民解放军联勤保障部队第900医院擅长妇产科、普通外科、急诊科、口腔科、神经外科等。
1、妇产科
系国家人事部博士后科研工作站，是第二军医大学博士学位授予点，现为国家卫生部辅助生殖技术中心、全军优生优育研究所，研究成果先后获得福建省科技进步一等奖一项、全军医疗成果一等奖一项、国家科技进步二等奖一项。
2、普通外科
是医院重点科室，收治大手术后和危重需重点监护病人。其中，科室对于重症急性胰腺炎的发病机制、治疗原则、手术时机的选择上提出了独到的见解，使重症急性胰腺炎的治疗水平处于国内领先地位。
3、急诊科
是我国军内较早创建的高效、高新技术学科之一，是全国首批“国际紧急救援中心网络医院”、“福建省120院前急救中心医院”、“福建省道路交通事故伤员救治定点医院”、“公安干警急救定点医院”，能够对各类急危重症患者提供及时、有效、整体的救治服务。
4、口腔科
设有国家人事部博士后科研工作站，拥有7个博士后带教学科，科室科研能力较强、研究水平较高，能够以最精湛的技术、最优质的服务、最大的诚意为广大患者服务，在该地区享有盛誉。
5、神经外科
是南京军区神经外科中心、全军候选微创神经外科中心，是福建省规模最大、最具有影响力的一个神经外科。共承担各类研究课题11项，在核心期刊上发表论文160余篇，主编专著3部，主译专著2部，参编专著5部，参译专著2部，获得军队及省级科研成果二、三等奖13项。
