玉溪市比较好的医院排名靠前的是玉溪市人民医院、玉溪市中医医院、玉溪市第二人民医院等。玉溪市人民医院在“2020届中国医院综合竞争力地级城市榜单”中医院位列162名；玉溪市中医医院中医特色突出，拥有国家级重点中医专科2个，省级重点专科5个；玉溪市第二人民医院拥有三个市级专业(学术)中心，是玉溪市内唯一一所专业精神心理卫生医疗机构。
第一名：玉溪市人民医院
玉溪市人民医院在“2020届中国医院综合竞争力地级城市榜单”中医院位列162名，是省内首批通过国家“高级卒中中心”、“中国胸痛中心”授牌的医院，现有2个国家级临床重点专科，9个省级临床重点专科等。同时承担起昆明医科大学本科临床班教学任务，开启云南省地市级医院临床本科教学的先例，。
第二名：玉溪市中医医院
玉溪市中医医院是一所集医疗、教学、科研、预防、养生、保健、康复为一体的中医特色突出的三级甲等中医医院，拥有国家级重点中医专科2个，省级重点专科5个，全国名老中医药专家传承工作室1个。先后获得“云南省中医系统先进集体”、“云南省第十三批文明单位”等荣誉称号。
第三名：玉溪市第二人民医院
玉溪市第二人民医院是集医疗、教学、科研、康复为一体的三级甲等专科医院，目前医院建成“玉溪市心理咨询与治疗中心”、“玉溪市精神疾病防治中心”、“玉溪市精神卫生医疗质量控制中心”三个市级专业(学术)中心，以精神、神经、心理卫生、老年病为医院特色专科，具有较强的技术优势，是玉溪市内唯一一所专业精神心理卫生医疗机构。
第四名：玉溪市儿童医院
玉溪市儿童医院是国家儿童医学中心消化专科联盟成员单位和国家先天性结构畸形救助项目定点医疗机构，为玉溪市儿童首选的，玉溪领先、云南先进的西南地区儿童医疗中心之一。