辽宁肛肠科排名比较靠前的有辽宁中医药大学附属第三医院、中国医科大学附属第一医院、中国医科大学附属盛京医院等，辽宁中医药大学附属第三医院大肠外科，是肛肠医院，是首批国家临床重点专科中医建设项目建设单位；中国医科大学附属第一医院肛肠外科，获批国家重点专科；中国医科大学附属盛京医院外科，为东北地区腹腔镜微创手术治疗先驱之一。
第一名：辽宁中医药大学附属第三医院
辽宁中医药大学附属第三医院(辽宁省肛肠医院)，是一所集医疗、科研、教学、康复为一体的国家三级甲等中医专科医院。医院于2001年被国家中医药管理局确定为“重点学科建设单位”。2002年被国家中医药管理局确定为“十五”重点专科(专病)项目建设单位。之后均以优异成绩顺利滚动为国家中管局“十一五”“十二五”“十三五”重点专科、重点学科建设单位。2011年获批首批国家临床重点专科中医建设项目建设单位。
第二名：中国医科大学附属第一医院-肛肠外科
中国医科大学附属第一医院肛肠外科，2007年获批国家重点专科，是全国最早开展CRH手术的单位，并且长期致力于开展创新微创手术，以应用到痔、肛瘘、大肠癌、肛裂等疾病的治疗。同时在国内较早开展了PPH、TST等微创手术，这些新术式为患者最大程度地减轻了肛肠疾病治疗过程当中的痛苦和创伤程度，为患者带来了福音，吸引了大量国内外的学者到该科参观进修学习。
第三名：中国医科大学附属盛京医院-外科
中国医科大学附属盛京医院外科，下设有结直肠肛门病外科，是该院最早开展腹腔镜大肠癌治疗的科室，为东北地区腹腔镜微创手术治疗先驱之一。研究腹腔镜低位保肛、保泌尿生殖功能，以无痛、微创、快速康复为特色，注重疾病的全周期治疗理念，同时擅长腹腔镜各种胃肠道及2型糖尿病新型手术治疗，复杂痔，肛门病治疗，普外科各种复杂手术治疗。
第四名：大连医科大学附属第一医院-肛肠外科
大连医科大学附属第一医院肛肠外科为辽宁省及院内重点学科，科室在结直肠肿瘤综合诊疗技术已达到国内先进水平。积极开展早期诊断，对中低位的T1期较早期直肠癌及巨大息肉，开展经肛门的低侵袭局部切除手术，在保证根治的前提下，保留了肛门功能，兼顾了患者的生活质量，该手术在国内处于领先水平。
第五名：辽宁省人民医院-肛肠科
辽宁省人民医院肛肠科，在肛门常见病、多发病，重症溃疡性结肠炎，结肠慢传输型便秘等疾病的诊疗方面，已达国内先进水平。肛肠科主要治疗肛门病(包括包块痔、肛瘘、肛周脓肿、肛裂、直肠息肉等)、顽固性便秘(出口梗阻型便秘、结直肠慢传输型便秘)、溃疡性结肠炎、重症溃疡性结肠炎以及大肠癌等疾病。
第六名：锦州医科大学附属第一医院-大肠肛门外科
锦州医科大学附属第一医院大肠肛门外科，是辽西地区规模最大的专业化结直肠疾病诊疗中心，辽宁医学院重点培育学科，硕士学位授予权学科。在省内较早开展了保留盆腔自主神经直肠全系膜切除术、直肠癌侧方淋巴结清扫术，超低位直肠癌保肛手术使直肠癌低位保肛率达到93％，术后术后生存率、并发症率达到国内先进水平。大肠癌手术例数与技术水平均稳居辽宁省前列。
第七名：大连市中心医院-肛肠外科
大连市中心医院肛肠外科目前在大连市享有极高威望，目前本科室医疗技术水平处于行业领先地位，在结直肠肿瘤疾病诊疗方面，科室开展腹腔镜技术，可完成包括腹腔镜下直肠癌根治术（TME、TaTME），腹腔镜下低位直肠癌ISR手术、超低位保肛手术、NOSES手术，腹腔镜下结肠癌根治术（CME）在内的一系列复杂手术，提高了患者术后生活质量，改善了患者远期生存率。
第八名：中国医科大学附属第四医院-肛肠外科
中国医科大学附属第四医院肛肠外科，是辽宁省临床重点专科、中国医大四院重点特色专科。同时，也是东北地区肛肠疾病救治中心。科室运用中西医结合、全程无痛疗法治疗各类痔病、肛周脓肿、复杂性肛瘘、肛裂、直肠脱垂、肛门直肠狭窄、肛门失禁、肛门瘙痒症。肛周坏死性筋膜炎、结直肠息肉、溃疡性结肠炎、克罗恩病、顽固性便秘、直肠阴道瘘、结直肠肿瘤、小儿肛肠疾病等肛肠疾病独具特色。