北海医院比较好的是北海市人民医院、北海市中医医院、合浦县人民医院，北海市人民医院是北海市唯一一家三级甲等综合医院，拥有7个自治区临床重点（建设）专科，5个北海市重点专科。北海市中医医院在国家三级公立医院绩效考核中进入百强，位列广西五强，拥有4个省级重点专科；合浦县人民医院创建了急救“五大中心”，开设7条急诊急救绿色通道，有健全的新型急诊急救体系。
第一名：北海市人民医院
北海市人民医院是北海市唯一一家三级甲等综合医院、全国爱婴医院、全国卫生系统先进集体。医院设临床医技科室54个。儿内科、急诊医学科、神经内科、麻醉科、产科、骨科、医学影像科7个自治区临床重点（建设）专科；内分泌代谢科、心血管内科、神经外科、神经内科、骨科5个北海市重点专科。2010年以来科研立项130项，其中国家自然科学基金1项；获奖35项。
第二名：北海市中医医院
北海市中医医院为集医疗、教学、科研、预防、保健、养生于一体的三级甲等中医医院，是广西中医药大学附属北海医院和研究生联合培养协作单位，广西高校临床教学基地A级教学医院。在国家三级公立医院绩效考核中进入百强，位列广西五强。骨伤科、脑病科、脾胃病科、儿科是省级重点专科，其中骨伤科也是省级重点学科。
第三名：合浦县人民医院
合浦县人民医院是一所集医疗、科研教学、预防保健、康复和健康管理为一体的三级综合医院。医院有建立健全的新型急诊急救体系，创建急救“五大中心”：胸痛中心、卒中中心、危重孕产妇救治中心、危重新生儿救治中心、创伤中心。开设急性心脑血管病、急性重症创伤、严重急腹症、高危新生儿、高危产妇、急性中毒、急性呼吸衰竭、消化道大出血等7条急诊急救绿色通道，实行院前急救——院内救治——重症监护的全程急救模式。
第四名：北海市第二人民医院
北海市第二人民医院是北海市社区卫生服务试点单位，学科门类齐全，医疗特色明显。近年开展的微创治疗颅内血肿、人工关节置换，新式剖宫产术、PLS阴式子宫切除术、超声乳化治疗白内障和小切口无缝线白内障摘除术及多种腹腔镜下微创手术等新技术新疗法均具备国际国内先进水平。