南方医科大学皮肤病医院擅长性病科、皮肤科、美容科、皮肤外科、整形美容外科。上述科室学科综合实力领先，临床专科诊治优势突出，能够为患者提供优质的医疗服务。
1、性病科
是院内重点发展的特色科室之一，具体负责“广东省性病诊疗医疗质量控制中心”日常工作。是广东省内唯一性病专科病房，主要收治神经梅毒、其他性病以及会阴生殖器皮肤病患者，年门诊量近4万人次，出院患者量200余人次，致力于我省梅毒防治工作，尤其为阻断梅毒母婴传播做出了突出贡献。
2、皮肤科
是广东省临床重点专科之一，拥有以国内著名教授顾有守担任首席专家，由多名主任医师、副主任医师以及博士、硕士组成的强大专业技术团队。在诊治各种皮肤良恶性肿瘤、瘢痕、血管性皮肤疾病、皮肤溃疡以及皮肤软组织缺损、畸形的修复等方面积累丰富经验。
3、美容科
是该院特色专科之一，下设微创治疗与年轻化中心，以瘢痕专病为重点发展方向，并涉足皮肤肿瘤、毛发、皮肤血管等专病。形成以修复重建为基础，以瘢痕为重点发展方向，利用多种先进治疗手段为广大患者提供优质的诊疗服务。
4、皮肤外科
是岭南地区较早成立的皮肤外科亚专科之一，是南方皮肤外科互助联盟主要成员单位。在诊治各种皮肤良恶性肿瘤、瘢痕、血管性皮肤疾病、皮肤溃疡以及皮肤软组织缺损、畸形的修复等方面积累丰富经验。
5、整形美容外科
是该院的特色专科之一，2021年上榜“广东医院最强科室推荐”榜单。以瘢痕专病为重点发展方向，并涉足皮肤肿瘤、毛发、皮肤血管等专病。开展自体脂肪移植在整形与修复重建技术，技术水平处省内先进水平，积累了丰富的临床经验。