上海口腔正畸科比较厉害的三个医院是上海交通大学医学院附属第九人民医院、复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院。
上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔正畸科作为国内学科发源地之一，是国家临床重点专科，亚专科设置齐全，学术引领地位显著。复旦大学附属中山医院口腔科在综合医院中特色突出，其种植牙技术与为心血管病患者开展的“心电监护拔牙”服务全国知名。复旦大学附属华山医院口腔科为博士生培养点及上海市口腔医学会副会长单位，在显微根管、口腔肿瘤等多领域实力雄厚。
1、上海交通大学医学院附属第九人民医院 口腔正畸科
科室为我国最早建立的口腔正畸学科之一，是国家临床重点专科，学术地位崇高。科室开设儿童早期矫治、隐形矫治、正畸-牙周、正畸-关节、正畸-正颌-唇腭裂、舌侧矫治六大亚专科门诊，具备顶尖的复杂牙颌面畸形多学科联合诊疗能力。作为英国爱丁堡皇家外科学院口腔正畸专科医师认证考试的亚太地区唯一考点，其国际影响力深远。
科室承担国家重点研发计划，研发成果丰硕，并牵头组建上海九院集团口腔正畸专科联盟，是引领全国的专业标杆。
2、复旦大学附属中山医院 口腔科
科室历史悠久，在综合性医院口腔科中特色鲜明、技术领先。其牙种植技术尤为突出，年种植手术量居于上海市前列，尤其在“全口即刻种植即刻修复”领域经验丰富，曾举办多期国家级种植学习班。科室另一大特色是在国内率先开展并为心血管疾病患者提供“心电监护下拔牙”服务，迄今已完成数万例，安全可靠。
以此为基础，全面带动了牙体牙髓、正畸、修复等各亚专科的协同发展。
3、复旦大学附属华山医院 口腔科
科室为国务院临床口腔医学博士生培养点、上海市执业医师规范化培训基地，并担任上海市口腔医学会副会长单位，学术与教学地位突出。科室下设八个亚专业，以疑难显微根管治疗、口腔颌面部肿瘤的多学科联合诊治、口腔黏膜癌前病变及疑难黏膜病的诊疗为核心特色，并在种植、牙周病、微创拔牙等领域并重发展。
科室设备先进，拥有口腔锥束CT、牙科显微镜、CAD/CAM系统等，承担多项国家自然科学基金项目，国内外学术交流活跃。
4、同济大学附属口腔医院 口腔正畸科
科室（含正畸一科、二科）是国家临床重点专科，并为中华口腔医学会及上海市口腔医学会口腔正畸专委会的重要常委/副主委单位。科室临床与科研实力雄厚，紧跟技术前沿，全面开展包括传统固定矫治、自锁矫治、无托槽隐形矫治、舌侧矫治及种植支抗在内的各项主流技术。
充分发挥专科医院多学科协作优势，在成人复杂病例的正畸-正颌外科、正畸-牙周、正畸-种植修复联合治疗以及儿童早期矫治、骨性错颌早期干预等方面形成了鲜明的专业特色。
5、上海交通大学医学院附属瑞金医院 口腔科
科室由临床经验丰富的高年资医师团队组成，在口腔常见病、多发病及疑难病的诊治方面经验扎实。尤其擅长口腔黏膜病（如口腔溃疡、扁平苔藓、白斑）、各类牙槽外科手术（如复杂拔牙）、牙列缺损缺失的修复（包括种植牙）以及牙周系统性疾病的综合诊疗。能够为患者提供从基础治疗到复杂种植修复的全程、综合性口腔医疗服务。
