天津市第五中心医院擅长的科室有心血管内科、骨科、普通外科、儿科、妇产科等。
1、心血管内科
天津市第五中心医院心血管内科为天津市滨海新区首批医学重点学科，包括普通心血管病房、心电遥测监护病房及CCU监护病房，擅长冠心病、高血压、不稳定性心绞痛、心律失常等常见心血管内科疾病的诊治。2002年率先在滨海新区开展选择性冠脉造影检查、冠脉介入治疗。长期开展心脏永久起搏器、三腔起搏器和心律转复除颤器植入术，开展室上性心动过速、房颤、室性早搏、室性心动过速的射频消融术等治疗。
2、骨科
天津市第五医院骨科是医院重点学科之一，在临床、科研、教学方面在天津滨海地区均处于领先地位。以创伤骨科和关节外科为特色。已开展全膝、髋关节置换手术，颈椎前路椎间盘摘除术，颈椎单开门、双开门成形术，胸腰椎骨折内固定术，腰椎间盘摘除术，颈、腰椎间盘射频消融术，腰椎骨折椎体成形术，膝关节镜下半月板成形术等。显微外科手术、手外伤功能重建术等复杂手术，在天津市有一定知名度。
3、普通外科
天津市第五医院普通外科在甲状腺、乳腺、胃肠道肿瘤、急腹症的治疗上积累了丰富的经验。其下设的肛肠外科对结直肠肿瘤、复杂性肠瘘、痔、肛裂、结直肠息肉、直肠损伤等肛肠外科疾病的治疗，及结肠镜的应用有较深的造诣。泌尿外科对肾上腺肿瘤、肾癌、膀胱癌、肾肿瘤、前列腺增生等常见病、多发病的治疗有丰富的经验。
4、儿科
天津市第五医院儿科是医院重点学科之一，技术力量雄厚，人员梯队合理，承担着滨海新区儿童的治疗及预防任务，在医教研方面起到指导作用。目前，儿科拥有心电监护仪、人工呼吸机、蓝光照射、抢救辐射台等先进设备。该科注重新知识、新技术的学习，具有较强的科研实力。近年来积极开展新项目，主持完成了天津市科研项目3项。儿科属于大内科综合科室，每年门、急诊量达7万人次，住院病人1500人次。每年重大抢救成功率达99%。
5、妇产科
天津市第五医院妇产科是集临床、教学、科研为一体的重点学科之一，是天津滨海新区病理产科技术指导及会诊中心。在妇科常见病方面开展了各类恶性肿瘤（子宫内膜癌、宫颈癌、卵巢癌、外阴癌等）的手术，特别是微创手术方面取得了显著成绩，如腹腔镜下全子宫切除术、次全子宫切除术等。并开展了新式剖宫产术、腹膜外剖宫产术、无痛人工流产、无痛分娩及产科各类手术等。