重庆甲状腺排名第一名的医院是陆军军医大学第一附属医院，看甲状腺可前往普外科就诊，该医院的普外科是国家重点学科、重庆市医学重点学科，而且科室的经验丰富，每年门急诊量在36000人次以上。此外，重庆医科大学附属第一医院和重庆大坪医院看甲状腺也比较好，如前者医院的乳腺甲状腺外科是国内最早成立的甲状腺外科（专科）之一；后者医院的乳腺甲状腺外科是国家重点学科。
第一名：陆军军医大学第一附属医院-普外科
陆军军医大学第一附属医院普通外科目前是集医疗、科研和人才培养为一体的国内知名的普通外科之一。科室为博士学位授权学科、国家重点学科、重庆市医学重点学科。现有微创胃肠外科中心、肿瘤生物治疗研究中心、微创疝修补诊疗中心、肛肠疾病诊疗中心。拥有国内一流的先进设备，包括多功能数字化腹腔镜及超声手术系统、流式细胞仪等。在甲状腺、乳腺等疾病的手术方面，治疗质量高，并发症少，疗效居国内先进水平。
第二名：重庆医科大学附属第一医院-乳腺甲状腺外科
重庆医科大学附属第一医院乳腺甲状腺外科，是国内最早成立的乳腺、甲状腺外科（专科）之一，近年来开展乳腺癌根治术后即刻和延期乳房重建术，包括背阔肌肌皮瓣乳房重建术、腹直肌肌皮瓣乳房重建术、假体植入乳房重建术、背阔肌+假体乳房重建术、扩张器植入乳房重建术以及重建术后脂肪移植，是西部地区首批开展此手术的科室，技术水平全国领先，成为国内病例数最多的单位之一。
第三名：重庆大坪医院-乳腺甲状腺外科
重庆大坪医院乳腺甲状腺外科，是集医、教、研为一体的国家重点学科，拥有先进乳腺甲状腺外科相关医疗设备，包括麦默通（mammotome）/安珂（EnCor）乳腺微创旋切系统、高频多普勒彩色超声、Hologic高频数字乳腺X光机、腔镜手术系统、乳腺触诊成像、乳腺微创手术可视化系统、甲状腺术中神经监测仪、乳腺前哨淋巴结活检系统等。
第四名：重庆医科大学附属第二医院-乳腺甲状腺外科
重庆医科大学附属第二医院乳腺甲状腺外科，是重庆市重点学科，是国家级乳腺癌精准治疗中心、国家级乳腺癌筛查基地、重庆市乳腺甲状腺微创治疗中心。目前开展的治疗项目包括乳腺癌的诊断、手术、放疗、化疗、内分泌治疗、分子靶向治疗在内的综合治疗，各种乳腺良性疾病的诊断、治疗及各种乳腺疾病的微创手术等。
第五名：重庆市人民医院-乳腺甲状腺外科
重庆市人民医院乳腺甲状腺外科，为重庆市甲状腺结节与甲状腺癌专病临床诊疗中心，重庆市临床重点专科，科室除常规开展各种乳腺癌根治术，乳腺癌保乳手术，乳腺癌保留腋窝手术，乳腺良性肿瘤开放切除术，乳腺良性肿瘤微创旋切术，甲状腺癌根治手术，甲状腺肿瘤切除术，甲状腺病变微波消融术，各种入路腔镜微创甲状腺癌手术和甲
第六名：重庆市妇幼保健院-乳腺甲状腺科
重庆市妇幼保健院乳腺甲状腺科，集医疗、保健、教学、科研于一体的现代化乳腺甲状腺专科，实施早期诊断、综合治疗、康复管理的规范化全程乳腺、甲状腺恶性肿瘤管理模式；开展乳腺良性肿瘤微创旋切手术（日间手术），开展个性化乳房重建及乳房整形手术；开展乳腺内窥镜检查并即可手术治疗；开展哺乳期乳腺炎综合治疗及母乳喂养指导。
第七名：重庆市第九人民医院-普外科
重庆市第九人民医院的普外科，为国家三甲医院重点学科，科室擅长胆囊切除、胆总管探查、取石、胆肠吻合、肝叶切除、肝脏移植、门脉高压症断流、分流，胰十二指肠切除、脾切除、甲状腺瘤切除、疝修补等手术。拥有彩超、术中B超，术中胆道镜，ERCP等系列先进设备，技术精湛，在诊治胆囊结石，肝内外胆管结石方面，达到国内先进水平。
第八名：重庆市第五人民医院-甲状腺乳腺外科
重庆市第五人民医院甲状腺乳腺外科是西部乳腺甲状腺专科联盟成员单位，主要从事乳腺、甲状腺、甲状旁腺疾病及胰腺内分泌肿瘤等疾病诊治、预防和康复。同时科室临床、科研、教学协调发展，承担重庆医科大学临床和理论教学，承担或参研省市级课题多项。
第九名：重庆市第六人民医院-普外科
重庆市第六人民医院的普外科，是南岸区重点专科，擅长于腹腔镜肝胆胰脾切除，腹腔镜胃、结直肠肿瘤根治、腹腔镜疝修补，微创治疗下肢静脉曲张，十二指肠镜对肝外胆道疾病及胆源性胰腺炎的微创治疗（不开刀手术），甲状腺癌根治手术，肝良、恶性肿瘤；胰腺、胃恶性肿瘤的血管介入治疗。
第十名：重庆医科大学附属永川医院-普外一科(乳腺、甲状腺、血管、疝外科)
重庆医科大学附属永川医院的普外一科(乳腺、甲状腺、血管、疝外科)，开展了腹腔镜下腹股沟疝补片修补术、乳腺微创旋切术、乳腺癌改良根治术、甲状腺癌根治术、彩超引导下PICC穿刺术大隐静脉曲张日间手术、外周血管造影术、主动脉夹层支架植入术、球囊扩张术等多项特色医疗技术。
