新疆小儿内科医院排名比较靠前的是乌鲁木齐儿童医院、新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院。
乌鲁木齐儿童医院小儿内科专注小儿消化及出疹性疾病，诊疗经验丰富。新疆维吾尔自治区人民医院儿科擅长儿童呼吸及过敏性疾病，综合诊疗能力突出。新疆医科大学第一附属医院儿科为省级临床重点专科，亚专业齐全，科研与临床实力位居全疆前列。
1.乌鲁木齐儿童医院 小儿内科
乌鲁木齐儿童医院小儿内科由临床经验丰富的主治医师以上职称人员组成，熟练开展小儿内科常见病、多发病及疑难病诊治，在腹泻、胃炎、肠炎、消化不良、腹痛、便秘、幼儿急疹、风疹等小儿消化系统及出疹性疾病治疗上具有显著优势，为患儿提供专业规范的内科诊疗服务。
2.新疆维吾尔自治区人民医院 儿科
新疆维吾尔自治区人民医院儿科由高职称、经验丰富的医务人员组成，科室擅长儿科各类常见病、多发病及疑难病诊治，在儿童感冒发烧、肺炎、气管炎等呼吸道疾病，哮喘等过敏性疾病以及发育行为相关疾病诊疗上优势明显，可全面满足小儿内科各类疾病的诊疗需求。
3.新疆医科大学第一附属医院 儿科
新疆医科大学第一附属医院儿科是自治区级临床重点专科，为博士、硕士研究生培养点，通过药物临床试验机构资格认定，科室设有呼吸、消化、重症等15个亚专业。科室主持多项国家级、省部级科研课题，获多项科研奖励，建成全疆一流的儿科疑难病症诊疗中心，可诊治各类小儿内科疑难危重病症，服务覆盖全疆及中亚地区。
4.新疆医科大学第二附属医院 儿科
新疆医科大学第二附属医院儿科依托医院重点消化专科平台，在小儿消化系统疾病诊疗上具备扎实专业基础，科室为新疆消化病学专科联盟常务理事单位、自治区食管疾病规范治疗联盟副组长单位，是国家药物临床试验消化专业认证科室，长期邀请内地知名专家指导，可规范开展小儿消化及内科常见病诊疗。
5.新疆医科大学第五附属医院 儿科
新疆医科大学第五附属医院儿科是集医教研于一体的综合性临床科室，为国家级儿科医师规培基地，以儿童呼吸道、消化道及新生儿疾病为诊疗重点。科室拥有智能化雾化中心、碳光子治疗仪等特色设备，碳光子治疗对小儿内科多系统疾病有效率达95%以上，实行24小时值守。
