广东艾滋病科比较厉害的医院南方医科大学南方医院、广州市妇女儿童医疗中心、南方医科大学皮肤病医院。
南方医科大学南方医院感染内科是国家传染病防治的重要平台，综合实力全国领先。广州市妇女儿童医疗中心感染科是华南最大的儿童感染性疾病诊疗中心。南方医科大学皮肤病医院性病科是省级性病诊疗质控中心，专攻梅毒防治。
1、南方医科大学南方医院 感染内科
科室创建于1951年，是集医疗、教学、科研、预防于一体的国家级传染病与肝病诊疗平台，学科地位与综合实力位居全国领先水平。作为感染性疾病危重症救治中心、细菌真菌感染诊治基地，科室在肝硬化门脉高压的微创介入治疗、危重症肝病管理、脂肪肝个体化诊疗及肝癌多学科诊疗方面达到国内领先。
拥有独立的临床大楼与先进监护设备，长期承担国家传染病防治、医学人才培养与科研重任，是华南地区最重要的感染与肝病临床与转化医学中心之一。
2、广州市妇女儿童医疗中心 感染科
该科是华南地区最大的儿童感染性疾病及儿童肝脏疾病临床诊疗中心，广东省儿童传染病危重症定点救治单位，并作为“广东省小儿感染与肝病联盟”牵头单位，多次获评“广东省最强科室”。科室在儿童重症感染性疾病精准诊疗、病毒性肝炎等方面科研实力突出，承担多项国家自然科学基金及国家重点研发计划项目，并与中科院病毒所等机构深度合作。
年门诊量超6.5万人次，临床与科研水平均处于国内儿科感染领域前列。
3、南方医科大学皮肤病医院 性病科
科室是医院重点特色科室，具体负责“广东省性病诊疗医疗质量控制中心”日常工作，是全省性病诊疗的规范制定与质量监控核心。科室设有目前广东省内唯一的性病专科病房，主要收治神经梅毒等重症患者。长期致力于梅毒防治，尤其在阻断梅毒母婴传播方面贡献突出。
科室承担多项国际国内性病/艾滋病防治研究项目，并在顶级期刊发表论文，是集临床、教学、科研与公共卫生职能于一体的专业性病诊疗机构。
4、中山大学附属第一医院 皮肤科
该科是国内大型教学医院中规模较大、设备齐全、技术力量雄厚的皮肤性病学科之一，集临床、教学、科研于一体。科室在皮肤病理诊断、性病实验室检测（省内首家通过“三级”规范化评审）、激光治疗及皮肤外科等方面技术全面，诊治水平达国内先进。门诊设有10个特色专科，能熟练处理各类少见、疑难和危重皮肤病。
科室科研方向明确，在性传播疾病、色素性皮肤病、自身免疫性皮肤病等领域均有建树，是华南地区皮肤性病诊疗的重要中心。
5、广州医科大学附属第一医院 感染内科
科室始建于20世纪60年代，现为“广东省临床重点专科”，是广东地区综合性医院中规模较大的感染性疾病科室之一。
作为首批国家级抗菌药物临床应用管理（AMS）平台依托单位，负责指导全院抗菌药物合理应用及复杂耐药菌感染救治。在不明原因发热、新发突发传染病（如新冠、登革热）诊治、病毒性肝炎及肝病管理方面经验丰富，并建立了成熟的发热患者一站式诊疗平台。科室科研实力强，曾获广东省科技进步二等奖等多项荣誉，并多次进入华南区专科声誉排行榜前列。
