上海生殖科医院排名第一的是复旦大学附属妇产科医院，该医院集爱遗传与不育诊疗中心为中国首家辅助生殖中心，是上海市规模最大、就诊人数最多、试管婴儿周期数最多的辅助生殖技术中心，率先在华东地区应用胚胎冷冻复苏技术获得成功。此外，上海交通大学医学院附属仁济医院生殖中心是国内首家通过DNV GL&RTAC辅助生殖专项国际认证的中心；上海市第一妇婴保健院妇科是上海市重中之重临床重点学科。
第一名：复旦大学附属妇产科医院-集爱遗传与不育诊疗中心
复旦大学附属妇产科医院集爱遗传与不育诊疗中心作为中国首家辅助生殖中心，集爱以精湛的医术， 先进的设备， 丰富的经验为广大不孕不育患者提供优质的服务。该科室为上海市规模最大、就诊人数最多、试管婴儿周期数最多的辅助生殖技术中心；上海市出生试管婴儿数最多的中心；率先在国内通过经皮睾丸内精子抽吸术(PTSA)结合试管婴儿技术；率先在华东地区应用卵胞浆内单精子注射术(ICSI)获得首例ICSI宝宝；率先在华东地区应用胚胎冷冻复苏技术获得成功。
第二名：上海交通大学医学院附属仁济医院-生殖中心
上海交通大学医学院附属仁济医院生殖中心于2004年首批获得卫生部开展辅助生殖技术的准入资质，是国内首家通过DNV GL&RTAC辅助生殖专项国际认证的中心。中心目前开展涵盖所有不孕不育诊疗技术项目，包括：体外受精-胚胎移植、卵胞浆内单精子注射、胚胎植入前遗传学诊断、供精和夫精人工授精、睾丸附睾显微取精、囊胚培养、辅助孵化、卵子体外成熟、卵子精子激活以及与不孕症有关的宫、腹腔镜手术等。
第三名：上海市第一妇婴保健院-妇科
上海市第一妇婴保健院妇科是上海市重中之重临床重点学科及同济大学医学院重点学科，设有普通妇科、妇科肿瘤、生殖外科、盆底重建与妇科HIFU五个亚专科，门诊开设了内分泌门诊、子宫肌瘤门诊、卵巢囊肿门诊、妇科泌尿与盆底重建门诊、肿瘤随访门诊、化疗门诊、宫腔镜门诊、术前门诊等特色门诊。拥有上海市母胎重点实验室和上海市产科模拟实训中心。东、西两院产科实行同质化管理，实行门诊—病房的一贯制诊疗和主诊组医生负责制。
第四名：上海交通大学医学院附属瑞金医院-生殖医学中心
上海交通大学医学院附属瑞金医院生殖医学中心，是上海瑞金医院重点发展学科之一，已获得国家卫生部批准开展人类辅助生育技术资质。科室就医环境温馨，诊疗流程方便，配备了先进的医疗设备，具有经验丰富的专家和医生，实验人员技术精湛，尤其是助孕种植率及妊娠率保持国内先进水平。科室承担并完成国家自然基金、863计划及市重大科研课题数项，在国内外专业期刊发表论文80余篇，SCI收录3篇。
第五名：复旦大学附属中山医院-生殖医学科
复旦大学附属中山医院生殖医学科，拥有胚胎培养体系和先进仪器的胚胎实验室。此外，生殖医学中心还拥有着一支近20年辅助生殖临床经验的医生、护理人员和实验室技术人员的团队。科室积极探索新技术，目前已经开展二阶段胚胎冷冻法和SEET（内膜刺激胚胎移植法冷冻及移植）。
第六名：上海交通大学医学院附属第九人民医院-辅助生殖科
上海交通大学医学院附属第九人民医院辅助生殖科是卫生部批准的开展辅助生殖技术的医疗机构，专业治疗各种男女不孕症，特别是采用各类辅助生殖技术治疗不孕症。可开展宫腔内夫精人工授精 (IUI) 技术和卵细胞浆内单精子注射 (ICSI) 等辅助生殖技术。中心具备全层流的取卵手术室、胚胎移植室、胚胎培养室、显微操作室、精液制备室胚胎冷冻及液氮储存室、宫腔镜手术室，配备了多台先进的超声诊断仪和胚胎实验操作所需要的全套设备。
第七名：上海市第六人民医院-生殖中心
上海市第六人民医院生殖中心，是上海市西南地区唯一开展辅助生育技术的三级甲等医疗机构，年诊治不孕症患者2万名。科室配备国际一流的先进设备如：四维彩色多普勒超声诊断仪、胚胎培养箱、超净工作台、显微操作系统等，技术力量雄厚。
第八名：上海长海医院-生殖医学中心
上海长海医院生殖医学中心，在不育不孕诊治、优生优育研究等领域取得多项重大突破，是华东地区规模最大、历史最久、综合实力最强的军队生殖医学中心。科室的试管婴儿成功率国内领先，畸形率和临床不良反应率低于国际标准。中心在个体化精准诊疗、采用不同的促排卵方案微刺激自然周期、高龄和卵巢功能低下不孕诊疗等方面处于国际领先地位。
第九名：上海交通大学医学院附属新华医院-生殖医学中心
上海交通大学医学院附属新华医院生殖医学中心，筹建于2015年8月，是经上海市卫计委批准、从事人类辅助生殖技术的专业科室。科室配备业界先进的全自动精液分析仪、体外授精工作站等高精尖医疗设备，在不孕不育的诊疗技术上处于国内领先水平。