南京中医肛肠科医院排名靠前的是江苏省中医院肛肠科、江苏省人民医院中医科、南京鼓楼医院中医科等，江苏省中医院肛肠科为国家中医临床优势专科，牵头制定多项国家级肛肠疾病诊疗共识；江苏省人民医院中医科为全国综合医院中医药工作示范单位，是国家药物临床试验机构中医消化专业科室；南京鼓楼医院中医科为江苏省综合医院临床重点专科、江苏省综合医院中医专业质量控制中心。
1、江苏省中医院 肛肠科
该科室始创于1955年，依托丁氏痔科、孟河吴门医派传承底蕴，结合现代外科技术迭代升级，是国内顶尖的中西医结合肛肠专科。科室为国家中医临床优势专科、中国炎症性肠病诊疗质控中心、中国中医医院学科十强专科，专科行业地位权威。科室深耕疑难肛肠疾病诊疗，2023年组建省级炎症性肠病诊疗中心，形成疑难肛管直肠疾病、炎症性肠病、复杂肠病三大核心诊疗体系。科室累计完成及在研19项国家自然科学基金课题，出版9部专科著作，多项专著填补国内专科空白，牵头及参与制定多项国家级肛肠疾病诊疗共识与指南。科室年门诊量9万余人次，拥有多款自研特色院内制剂，可开展机器人、腹腔镜微创肛肠手术及各类保留括约肌疑难术式，中西医结合诊疗水平稳居全国前列。
2、江苏省人民医院 中医科
该科室是首批全国综合医院中医药工作示范单位，依托完善的中西医结合诊疗体系，深耕肛肠及盆底相关疑难病症诊疗。科室开设多类特色亚专科，擅长以中西医结合方式逆转胃肠癌前病变、调理慢性胃肠疾病，可针对性改善慢性肠炎、顽固性便秘、肛周反复不适、盆底功能紊乱等肛肠相关问题，弥补单一治疗方式的短板。科室医教研一体化发展优势突出，汇聚多名省级名中医、中西医结合专家，拥有高层次人才梯队，承担多项国家级、国际合作科研课题。科室日均门诊量达1300人次，位居全国综合医院中医内科首位，依托现代化诊疗设备与个体化辨证方案，对各类久治不愈的肛肠、胃肠盆底疑难杂症具备极强的诊疗能力。
3、南京鼓楼医院 中医科
该科室是江苏省综合医院临床重点专科、省中医专业质量控制中心，专注针药结合、中西医结合诊治肛肠与盆底功能障碍性疾病。科室深耕胃肠功能障碍、顽固性便秘、盆底综合征等肛肠相关疾病，打造出成熟的特色诊疗技术，其中八髎穴深刺法可针对性改善出口梗阻性便秘、盆底肌肉功能异常等肛肠常见问题，技术疗效确切。科室年平均门诊诊疗15万人次，临床诊疗经验丰富，依托国家及省级多项科研课题支撑，持续优化肛肠慢病、盆底疾病的中医诊疗方案。同时结合中药内服、特色针灸、经典方剂调理等多种方式，兼顾肛肠疾病治疗与术后康复、慢病养护，针对炎症性肠病、慢性便秘、盆底功能紊乱等肛肠疑难病症形成专属规范化诊疗体系。
4、东南大学附属中大医院 中医内科
该科室作为医院老牌重点专科、江苏省综合医院示范中医科，擅长运用传统中医与中西医结合方式调理各类慢性胃肠、肛肠相关疾病。科室针对难治性胃肠疾病、不明原因的腹痛腹泻、慢性便秘、肠道亚健康状态等肛肠关联病症，依托辨证施治体系实现精准调理，有效改善各类常规治疗效果不佳的肛肠慢性问题。科室配备TDS远程经络检测技术、智能通络治疗仪等特色设备，辅助精准辨证，结合中药内服、经络调理等方式，适配肛肠慢病、术后体虚、肠道功能紊乱的长期养护与治疗。科室深耕中医临床数十年，承担多项省级科研项目，凭借温和高效的中医调理方案，为各类肛肠慢性疾病患者提供稳定、长效的诊疗服务。
5、南京市第一医院 中医科
该科室集医疗、教学、科研于一体，依托特色中医诊疗技术，专注调理脾胃湿热、湿气瘀滞引发的各类肛肠及胃肠问题。科室独创系统祛湿法，针对湿气夹杂寒、热、瘀、郁引发的顽固性便秘、慢性肠炎、肛周湿热不适、胃肠功能紊乱等肛肠常见病症，从根源调理体质、纠正脏腑失衡，实现标本兼治。科室同时运用针刺、艾灸、埋线、小针刀等多种针灸特色技术，辅助改善肛肠术后恢复、盆底经络瘀堵、肛周慢性疼痛等问题，搭配冬病夏治特色项目，巩固肛肠慢病诊疗效果，适合各类肛肠慢性疾病的日常调理与康复治疗。
