北京小儿风湿免疫科医院排名靠前的是首都医科大学附属北京儿童医院、首都儿科研究所附属儿童医院、北京大学第一医院。
首都医科大学附属北京儿童医院国内首个儿童风湿免疫专科，STEM学科排名全国第一，国际专业影响力突出。首都儿科研究所附属儿童医院全国儿童风湿免疫专业排头科室，疑难危重病例诊治水平国内领先，免疫性疾病先进治疗技术应用经验丰富。北京大学第一医院我国现代儿科发源地之一，儿内儿外均达顶尖水平，多学科为国家重点学科。
1.首都医科大学附属北京儿童医院 风湿科
首都医科大学附属北京儿童医院风湿科创立为国内首个儿童风湿免疫病专科，STEM儿童风湿病学与自体免疫病学科排名全国第一，是大中华区唯一亚太免疫缺陷“卓越中心”。牵头制定多项国家级诊疗共识，引领国内行业标准，疑难危重症救治成功率全国领先，常见风湿疾病患儿10年生存率超95%。
精准诊疗涵盖基因诊断、生物制剂、造血干细胞移植等，达国际先进水平。承担国家“十四五”重点研发计划等多项重大课题。
2.首都儿科研究所附属儿童医院 风湿免疫科
首都儿科研究所附属儿童医院风湿免疫科是全国儿童风湿免疫专业排头科室，以儿童风湿免疫疑难危重病例诊治为核心特色，在系统性红斑狼疮、幼年特发性关节炎等疾病诊疗上居国内领先水平。熟练运用生物制剂、靶向治疗、造血干细胞移植等先进技术治疗难治性自身免疫病及免疫缺陷病，开展关节超声、肾穿刺活检等特色诊疗手段。
承担多项国家级、市级科研课题，参编多部儿科风湿病临床专著，学科成员在中华医学会儿科学分会等全国性专业学组任职，发表多篇SCI及中华核心期刊论文，临床与科研结合紧密。
3.北京大学第一医院 儿科
北京大学第一医院儿科是我国最早建立的现代儿科之一，是国家首批博士点、博士后流动站，连续获评国家重点学科，儿内科与小儿外科均实力顶尖。儿内科覆盖各类儿童重症、肾病、血液病等，多个亚专业为国家级临床重点专科，是国内多个儿科疾病联盟牵头单位；
小儿外科由张金哲院士创立，被誉为“中国小儿外科之母”，腹腔镜微创治疗、小儿神经外科诊疗技术达国际领先，是国内最大的小儿脑积水诊治中心。学科承担多项国家级科研课题，成果获国家科技进步二等奖等重磅奖项，人才培养体系完善，为国内儿科输送大量顶尖人才。
4.北京协和医院 儿科
该科孕育多位儿科奠基人和学科大家，依托协和医院全国疑难重症诊治指导中心的综合优势，在早产儿、遗传病及儿科疑难罕见病诊治方面国内享誉盛名。设七大专业组，各亚专业诊疗水平始终保持行业顶尖，为大量疑难、罕见病患儿明确诊断并制定精准治疗方案，凭借扎实的医疗与科研实力，多次斩获各级医疗科研成果奖励。
5.中国人民解放军总医院 小儿内科
中国人民解放军总医院 小儿内科是南开大学儿科学博士、硕士学位点及博士后科研工作站，是集医疗、教学、科研、保健于一体的综合性儿科。儿童血液肿瘤、神经疾病诊治为核心特色，国内率先开展儿童自体外周血干细胞移植，急性淋巴细胞性白血病5年无病存活率超70%，多学科协作治疗晚期神经母细胞瘤疗效显著；
小儿神经疾病实现诊疗与康复一体化，在国内外享有高声誉。承担国家863计划等23项各级科研课题，获宋庆龄儿科医学奖、中华医学科技奖等多项大奖，国际人才培养合作深入。
