河南中医药大学第一附属医院擅长呼吸与危重症医学科、脾胃肝胆病科、心血管科、脑病科、周围血管科，这些科室学科特色鲜明，优势明显，可为患者提供高水平、高质量的诊疗服务。
1、呼吸与危重症医学科
是河南省较大的中医、中西医结合呼吸疾病诊疗中心，是国家中医临床研究基地重点研究慢性阻塞性肺疾病的基地建设单位；是卫生部国家中医临床重点专科建设、全国慢性阻塞性肺疾病中医诊疗中心；国家中医药管理局“十一五”重点学科建设单位；国家中医药管理“十一五”重点专科；国家临床重点专科（中医专业）建设单位；美国BUXCO研究系统全球示范试验室。
2、脾胃肝胆病科
是国家临床（中医）重点专科、国家中医药管理局重点学科、国家中医重点专科、全国肝胆病防治技术示范基地。率先在河南省中医界开展了无痛胃镜、无痛肠镜技术，开展有脐针、脐火、透穴埋线等30余项中医特色治疗技术，在缓解功能性胃肠病引起的胃痛、胃胀、腹痛、泄泻、便秘等方面起着主导治疗作用。
3、心血管科
是国家区域中医（专科）诊疗中心建设单位、国家卫生部临床重点专科，是国家中医药管理局重点学科、国家中医药管理局重点专科。拥有河南省较大的中医、中西医结合心血管疾病诊疗中心，发挥中医整体观念和辨证施治优势，形成了中西医结合三位一体的心脏康复治疗新模式，成为全国心脏康复中医特色示范中心。
4、脑病科
是国家区域中医专科诊疗中心建设单位，国家中医药管理局重点专科、重点学科，国家卫生健康委临床（中医专业）重点专科。作为国内较早成立的中医脑病专科，现已发展成为国内具有较大影响力的脑病诊疗中心，尤其是在中西医结合治疗急、慢性脑血管病、眩晕、头痛等疾病方面，疗效居国内领先水平。
5、周围血管科
由全国名老中医崔公让教授于1985年创立，是河南省成立较早、规模较大的省级专科，目前是国家中医药管理局重点专科，在全国中西医结合防治周围血管病领域内具有较大的影响。该科在省内相继率先开展了选择性血管造影、球囊扩张及支架置入等现代血管外科手术，对血栓闭塞性脉管炎、动脉硬化闭塞症、糖尿病肢体坏疽等周围血管疾病的综合治疗取得了良好效果。
