无锡市第二人民医院擅长风湿免疫科、呼吸与危重症医学科、老年医学科、神经内科、消化内科，这些科室都有着高超的诊疗技术，患者可根据自身需求选择。
1、风湿免疫科
为无锡地区最具规模和影响力的风湿免疫专科。科室设置齐全，技术力量雄厚，服务质量上乘，集医疗、教学、科研、患者教育为一体，在市内处于领先地位。采用国际通用的诊断标准，严格做到合理检查、合理诊断、合理治疗，并取得了满意的疗效。
2、呼吸与危重症医学科
是无锡市重点专科建设单位，系全市首家成立呼吸重症监护病房（RICU）的科室。目前已成为一个集临床、教学、科研为一体的特色专科，综合实力居全市前列，在省内亦享有较高声誉。主要致力于各种急危重症的诊断与治疗。
3、老年医学科
是无锡地区最早成立的老年医学科，为无锡市医学重点专科，同时还是住院医师规范化培训基地。科室医疗设备齐全，诊治范围广，涵盖心脑血管、呼吸系统、消化内科、内分泌等领域，年门诊、住院人次均位居全市之首，在市内享有较高的声誉。
4、神经内科
是集医疗、教学、科研为一体的临床专业学科，是国家卫计委脑卒中筛查与防治基地、江苏省临床重点专科。下设病房、急诊、神经电生理室等，专业技术力量雄厚，在国内较早开展了卒中病人规范化诊治，在癫痫、神经性头痛、帕金森病等方面具有丰富的诊疗经验。
5、消化内科
是无锡地区最早的消化内科专科，是江苏省临床重点专科、无锡市重点学科、国家级药物临床试验基地。下设消化内科专科门诊、专家门诊等，对于急性重症胰腺炎、上消化道大出血、难治性炎症性肠病等疑难危重疾病拥有丰富的临床诊疗经验，科室规模及技术均在无锡市领先。
