合肥呼吸内科医院排名比较靠前的是安徽医科大学第一附属医院、安徽省立医院、安徽医科大学第二附属医院。
安徽医科大学第一附属医院呼吸内科是卫计委国家临床重点专科建设项目及安徽省呼吸病学主任委员所在地，在疑难危重病例抢救方面屡获殊荣。安徽省立医院呼吸内科是国家呼吸与危重症医学科规范化建设优秀单位及中国呼吸罕见病联盟创始单位，荣获安徽省科技进步奖一等奖。安徽医科大学第二附属医院呼吸内科是安徽省临床医学研究中心及安徽省“十三五”重点专科，拥有呼吸介入诊疗特色的肺癌治疗中心。
1.安徽医科大学第一附属医院 呼吸内科
安徽医科大学第一附属医院呼吸内科是卫计委国家临床重点专科建设项目、安徽省教育厅重点学科及安徽省呼吸病学主任委员所在地，拥有独立的支气管镜室、内科胸腔镜室和省级实验室。科室常规开展电子支气管镜检查、CT引导下经皮肺穿刺检查及肺癌射频消融术等先进技术，在经支气管镜介入治疗项目如高频电凝术、支架植入术等方面技术成熟。
科室对肺癌、慢性阻塞性肺病、呼吸衰竭等疾病诊疗经验丰富，尤其在危重病人抢救治疗方面有独到见解，多次在医院疑难危重病例抢救评比中获奖。科室先后主持中荷国际合作项目、国家自然科学基金等数十项课题，参与国家“973”项目，发表SCI论文60篇，是国家药物临床试验基地。
2.安徽省立医院 呼吸内科
安徽省立医院呼吸内科是国家呼吸与危重症医学科规范化建设优秀单位、中国呼吸罕见病联盟创始单位及安徽省卫生医疗重点专科。科室是国家卫健委肺癌诊断与治疗示范基地，也是安徽省呼吸专科联盟、安徽省呼吸罕见病专科联盟牵头单位。
科室拥有美国梅奥医学中心特聘专家及多位博士生导师，提供从肺癌早期诊疗到晚期精准诊疗、呼吸内镜介入诊疗及疑难罕见病诊疗的全方位服务。科室近年来承担国家自然科学基金及国家十三五精准医学项目等多项课题，在抗击新冠肺炎疫情中表现突出，荣获多项省部级荣誉和安徽省科技进步奖一等奖。
3.安徽医科大学第二附属医院 呼吸内科
安徽医科大学第二附属医院呼吸内科是安徽省临床医学研究中心、安徽省“十三五”重点专科及国家食品药品监管局认定的药物临床研究机构。科室设有肺部感染、肺癌与呼吸介入诊疗等亚专科，利用高通量基因测序技术实施肺部感染精准治疗，并开展无痛超声支气管镜诊疗、硬质支气管镜及CT引导下经皮肺穿刺射频消融等新技术。
科室在抗击新冠肺炎疫情中表现优异，呼吸与危重症医学科党支部荣获“全省卫生健康系统抗击新冠肺炎疫情表现突出集体”称号，多名个人荣获安徽省五一劳动奖章及抗击新冠肺炎疫情先进个人等荣誉。科室主持国家自然科学基金4项，近5年发表SCI收录文章40余篇。
4.合肥市第一人民医院 呼吸内科
合肥市第一人民医院呼吸内科是合肥市临床重点专科、合肥市医学会呼吸病学分会主委单位及合肥市呼吸内科质控中心主任单位。科室建立了首都医科大学潮阳呼吸支持学院安徽分院及合肥市呼吸系统疾病临床医学研究中心，通过了PCCM认证。在新冠肺炎疫情期间，科室整体投入抗疫一线，新冠肺炎治愈率达100%，率先完成合肥市定点医院“清零”任务。
科室在无创通气技术的应用、慢性气道疾病和睡眠呼吸障碍的诊疗及临床科研领域处于国内先进、省内领先水平。学科带头人丁震为安徽省学术和技术带头人、合肥市名医工作室领衔人，擅长慢性气道疾病、呼吸系统危重症及肺癌诊治。
5.合肥市第二人民医院 呼吸内科
合肥市第二人民医院呼吸内科是国家住院医师规范化培训基地、国家PCCM科介入呼吸病学及呼吸康复进修基地。学科分设感染、呼吸慢病与康复、呼吸危重症、胸部肿瘤与介入呼吸病学四个独立病区的亚专科，设有呼吸内镜与介入诊疗中心。科室常规开展俯卧位通气技术、床旁血液净化技术、超声支气管镜检查+快速评价技术及经皮肺部肿瘤热消融术等特色技术。
近年来科室发表SCI论文14篇，最高影响因子7.4分，主持和参与各级各类科研项目30余项。科室在复杂感染的病原微生物基因测序、呼吸慢病康复技术及气道支架置入技术等方面具有丰富的临床经验。
