赣州小儿呼吸科医院排名靠前的是赣州市人民医院儿科、赣南医学院第一附属医院儿科、赣州市妇幼保健院儿科等，赣州市人民医院儿科独立建科50年，开设有专门的儿童呼吸专业组，年门急诊量达15万余人次；赣南医学院第一附属医院儿科设置独立小儿呼吸亚专科与小儿哮喘专科门诊，为江西省内领先学科，是江西省首家儿童医学中心核心组成部分；赣州市妇幼保健院儿科是赣州市儿科急危重症病人的抢救中心，在小儿支气管哮喘等呼吸疾病诊疗领域有较深入的研究。
1、赣州市人民医院 儿科
该科室独立建科50年，形成了多学科交叉的发展格局，开设有儿童呼吸专业组、NICU、PICU、儿童肾脏风湿病科等多个特色专科及专业组，在儿童呼吸系统疾病及各类儿科常见病、多发病的诊疗上积累了丰富的临床经验。科室年门急诊量15万余人次，年出院病人最高近9000人次，诊疗服务覆盖范围广，依托PICU、NICU的重症监护支撑，可同步开展儿童呼吸危重症的规范化救治，能够满足不同年龄段儿童的呼吸疾病诊疗需求。
2、赣南医学院第一附属医院 儿科
该科室设置有独立的小儿呼吸亚专科，开设小儿哮喘专科门诊，配套高频及常频呼吸机、无创呼吸机、儿童急救除颤仪、血气分析仪等先进诊疗设备，可开展小儿支气管镜及肺泡灌洗术、胸腔闭式引流术、各类呼吸疾病的呼吸机治疗、小儿CRRT技术等诊疗项目，每年挽救危重患儿数百人。科室年门诊量10万人次以上，年住院1万人次以上，为江西省内领先学科，是国家发改委获批的江西省首家儿童医学中心核心组成部分，NICU为省级危重新生儿救治中心，同时也是江西省儿科专业住院医师规范化培训基地，拥有硕士学位授权点，承担各级医疗类课题几十项，取得一批科技成果，出版教材3部。
3、赣州市妇幼保健院 儿科
该科室对小儿各类疾病的诊治处于全市领先水平，是赣州市儿科急危重症病人的抢救中心，在小儿支气管哮喘等儿童呼吸系统疾病的治疗上有较深入的研究，依托成熟的危重症救治体系和先进设备，可开展儿童呼吸类常见疾病、疑难疾病及呼吸危重症的规范化诊疗。科室配套有美国鸟牌呼吸机、多参数监护仪等先进诊疗设备，年门诊量7万余人次，诊疗服务覆盖赣州全域及周边邻近区域，在儿童呼吸疾病诊疗领域积累了扎实的临床经验，获得患儿家属的广泛认可。
4、赣州市立医院 儿科
该科室配备有小儿呼吸方向的专科医师，配套美国AVEA新生儿呼吸机、双水平无创呼吸机、史蒂芬无创呼吸机、压缩雾化泵等呼吸诊疗相关先进设备，在支气管肺炎、慢性咳嗽、喘息性疾病、过敏性呼吸道疾病等儿童常见呼吸系统疾病的诊疗上疗效显著。科室依托新生儿及儿童重症监护室的支撑，可开展儿童呼吸危重症及新生儿呼吸相关疾病的救治，危重疑难病人抢救成功率高，曾成功救治胎龄27周的超早产儿。科室2018年被授予“章贡区危重新生儿救治中心”，开展多项儿科相关课题研究并取得重要成果，多次获得市、区科技进步奖。
5、宁都县人民医院 儿科
该科室经过半个多世纪的发展，是全县技术水平最高、抢救设备最全的儿科疾病诊疗中心，在同类县级医院中处于领先地位，诊疗服务覆盖整个县区及周边地区。科室配备有高频呼吸机等先进抢救设备，对儿童呼吸系统常见病及呼吸相关危急重症如重症肺炎、呼吸衰竭等摸索出了具有自身特色的抢救措施，抢救成功率在同级医院中达到较高水平，对各类儿科少见疑难杂症也有相当的诊疗经验。科室年门诊量超过2万人次，年收治患者超过6000人次，重视学科能力建设，每年选派人员参加全国性儿科学术会议，同步跟进儿科前沿诊疗技术，同时承担医学院校的临床实习带教工作。
