湖州儿科医院排名靠前的是湖州市妇幼保健院儿科、湖州市中心医院儿科、湖州市第一人民医院儿科等。湖州市妇幼保健院儿科是该院临床一级学科，为国家级儿科住院医师规范化培训专业基地，湖州市危重新生儿救治中心、湖州市新生儿复苏质控中心均挂靠于此；湖州市中心医院儿科实行“大综合、小专科”发展战略，为国家级住院医师规范化培训基地，近5年承担多项省市厅级科研课题；湖州市第一人民医院儿科是湖州地区最早的儿童专科，年门急诊量达25万人次，位居湖州市第一。
1、湖州市妇幼保健院 儿科
该科室是湖州市妇幼保健院临床一级学科，2009年新生儿科方向通过评审被授予湖州市卫生局第二批临床医学重点学科，2011年成为首批浙江省儿科住院医师规范化培训基地，2014年成为国家级儿科住院医师规范化培训专业基地。湖州市危重新生儿救治中心、湖州市新生儿复苏质控中心均挂靠于此。所在医院2019年成为浙江大学医学院附属儿童医院湖州分院，科室依托该合作平台，已形成以NICU为中心的区域性危重症新生儿救治网络，建立了危重新生儿转运网络，内分泌遗传代谢、呼吸（含哮喘）、神经、消化、早产儿MDT等专科逐步发展成熟，以提升湖州地区儿科医疗水平为发展宗旨，持续推动区域儿科诊疗能力提升。
2、湖州市中心医院 儿科
该科室实行“大综合、小专科”发展战略，开设儿科24小时发热门诊、急诊及相关病房，覆盖儿童全科、呼吸、消化、神经、内分泌、行为心理评估、哮喘、特异性脱敏治疗等多个亚专科专家门诊。配备儿童长程视频脑电图、儿童呼吸睡眠监测仪、儿童电子支气管镜、儿童电子胃镜、有创呼吸机、双水平无创呼吸机、湿化高流量吸氧仪、床旁B超等多种专科医疗器械。该科室为国家级住院医师规范化培训基地，同时是温州医科大学、湖州师范学院医学院见习、实习基地；近5年获省部级科研课题1项、市厅级科研课题3项，院校级教学科研课题2项，发表SCI论文3篇、国内1级、2级杂志论文30余篇。
3、湖州市第一人民医院 儿科
该科室是湖州地区最早的儿童专科，亚专科设置齐全，尤其在呼吸、神经与行为发育、消化、内分泌、重症等领域具备先进诊治技术，各亚专科定期邀请国内知名儿科专家授课，紧跟医学发展前沿。科室年门急诊量位居湖州市第一，达25万人次，年出院病人4000人次。该科室是湖州市医学会儿科专业委员会主任委员单位，湖州市儿科质控中心挂靠单位，同时为湖州市手足口病定点医疗单位、国家流感哨点监测和食源性疾病监测单位，承担大量公共卫生任务。近5年共申请科研项目13项，其中省自然基金1项；发表省级以上论文近30篇，其中SCI论文3篇；获国家级专利14项，还承担基层医生儿科诊治技术培训任务。
4、长兴县妇幼保健院 儿科
该科室开设有门诊、急诊、新生儿科、儿科病房，在小儿呼吸道、消化道等常见病、多发病的诊治方面积累了丰富经验，年诊治人数以20%以上的幅度递增，同时开展骨碱性磷酸酶、血微量元素测定等特色检查项目。新生儿科方向配备暖箱、蓝光箱、心电氧饱和度监测仪、血糖测试仪、经皮测胆红素仪、超声雾化器、t-组合复苏装置等齐全的仪器设备，在高危儿、早产儿、新生儿黄疸和新生儿期感染性疾病的治疗、护理方面经验丰富，疗效确切。该科室产后母婴同室病房10余年来持续开展新生儿听力筛查和苯丙酮尿症、先天性甲状腺功能低下症等新生儿疾病筛查，力争实现相关疾病早发现早治疗，保障患儿发育水平接近健康儿童；还开设多项新生儿特色服务项目，广受年轻家长欢迎。
5、长兴县人民医院 儿科
该科室新生儿科可收治新生儿高胆红素血症、败血症、肺炎、早产儿、肺透明膜病、气胸等疾病，其中肺透明膜病、气胸为县域内唯一可收治的病种，配有全县仅1台的新生儿呼吸机。科室开设的小儿生长发育门诊已开展10年，为全县唯一、首家的生长发育专科门诊，可诊治矮小症、性早熟、肥胖症、甲亢、甲减等疾病；还开设小儿神经内科专科门诊，可诊治各类癫痫、脑瘫、不明原因抽搐、多动症、小儿抽动症等，每半月有浙二医院小儿神经内科专家来院坐诊。该科室是全县唯一开展小儿腰穿检查的科室，可收治川崎病、血小板减少性紫癜、过敏性紫癜、重症肺炎、各种脑炎等重症及特殊疾病，同时可开展儿童无痛胃镜检查。
