北京看消化科比较好的医院是北京协和医院、解放军总医院、首都医科大学附属北京友谊医院，北京协和医院消化内科是一个高水平的消化病学、内镜学以及疑难重症的诊治中心，亚专业齐全，是在国内外均很有影响的重点学科。解放军总医院消化内科为北京市重点学科，首都医科大学附属北京友谊医院消化内科是国家重点(培育)学科、北京市重点学科等。
第一名：北京协和医院-消化内科
消化内科是北京协和医院成立最早的专科之一，现已发展成为在国内外均很有影响的重点学科。消化内科的亚专业齐全、人才济济、临床和实验室技术实力雄厚，是一个高水平的消化病学、内镜学以及疑难重症的诊治中心。科内设有高水平的、面向全国的炎症性肠病和胰腺疾病诊治中心、消化内镜培训中心以及胃肠功能和动力疾病诊治中心。
第二名：中国人民解放军总医院-消化内科
解放军总医院消化内科2008年被评为北京市重点学科，2013年被评为全军首批国家临床医学专科中心建设单位。医学部包含消化内镜超级微创与修复（消化军事医学）、食管胃、肠道、肝脏，胆系、胰腺疾病及肠道微生态等亚专业，拥有7个派驻科室。在消化系统常见病、疑难病诊治和急危重症救治方面特色鲜明，拥有在面积、规模、技术等方面领先世界的国际一流消化内镜中心。
第三名：首都医科大学附属北京友谊医院-消化内科
首都医科大学附属北京友谊医院消化内科，以食管、胃肠及肝胆胰腺疾病的内镜介入(微创)诊断与治疗为特色，国内领先、国际知名，是首都医科大学消化病学系挂靠单位、国家重点(培育)学科、北京市重点学科。在消化系疑难病及肿瘤的发病机制、早期诊断和治疗方面不断创新、突破，多次承担国家“十一·五”支撑计划、“863”计划、国家自然科学基金、卫生部公益性项目、国家科技部之国际合作项目、“九·五”攻关项目、北京市科委重点科研项目。
第四名：北京大学第一医院-消化内科
北京大学第一医院消化科是国家级临床重点专科，国家认定的全科医师、住院医师和专科医师规范化培训基地。科室目前可完成胃镜检查、肠镜检查、内镜下粘膜切除术（EMR）、胶囊内镜、胃造瘘、经内镜鼻空肠管置入、内镜下异物取出、内镜下止血等多项技术，2013年引进的共聚焦显微内镜使消化内科对消化道早期肿瘤的筛选和癌前病变的监测达到世界领先水平。
第五名：北京大学第三医院-消化科
北医三院消化科，作为第一批国家临床重点专科，现已发展为集门诊、病房、胃肠造影室、胃肠动力室、病理实验室、内镜室为一体的北京大学消化疾病研究中心。多年来北医三院消化科开创了国内多项内镜的第一:1974年率先开展 ERCP技术，1982年率先开展放大内镜和单人结肠镜检查，1985年率先开展超声内镜，1991 年率先开展早期胃癌内镜下治疗技术，1995年率先进行经皮内镜下胃造瘘技术，这些先进的技术和设备为临床病人的诊治解决了很多疑难问题。
第六名：北京大学人民医院-消化内科
北京大学人民医院消化内科目前拥有病房、门诊（并设有非酒精性脂肪性肝病，炎症性肠病及胃食管反流专业门诊）、内镜中心、胃肠动力室、超声检查室和实验室，成为集临床、科研、教学为一体的综合能力较强的科室。 多年来，炎症性肠病和慢性肝病的诊疗一直是消化内科临床及科研优势发展方向，在难治性炎症性肠病、非酒精性脂肪性肝病、免疫性肝病及疑难重症肝病诊治方面有丰富的诊疗经验。
第七名：北京天坛医院-消化内科
北京天坛医院消化内科以肝、胆、胰腺疾病诊治为特色，尤其是使用超声内镜以及穿刺技术对于胰腺疾病(慢性胰腺炎、早期胰腺癌等)诊断方面，经验丰富，深受广大患者的好评。科室承担“十三五”重点项目，取得一系列科研成果，使科室在肝病方面的研究在同行学科中享有一定声誉。
第八名：首都医科大学附属北京同仁医院-消化内科
首都医科大学附属北京同仁医院消化内科是一个具有悠久历史及厚重学术基础的科室，学术专业齐全，具有先进的诊疗技术设备，是较早开展胃肠镜检查技术的北京市级医院之一，能进行各种消化管疾病的诊断及治疗，并开展更为人性化的无痛苦胃肠镜检查与治疗工作。
第九名：首都医科大学宣武医院-消化科
首都医科大学宣武医院消化科以老年消化疾病、消化危重症诊疗为特色，国内领先，担负着北京市老年健康服务体系的龙头和执行管理职能使命。消化科突出老年疾病特点，并作为全国消化危重症诊治中心之一，采用特色诊疗手段，为每一位患者提供全程、全方位、人性化的优质服务。
第十名：中日友好医院-消化内科
中日友好医院消化内科是中日友好医院重点科室之一，是北京市中西医结合肝病学会主任委员单位、国家中医药管理局中西医结合临床国家重点学科。科室以消化系疾病的内镜诊治、慢性肝病、功能性胃肠病和胃肠动力障碍性疾病以及炎症性肠病为主要医疗特色和研究方向，以中西医结合为特色。