菏泽甲状腺科医院排名靠前的是菏泽市立医院乳腺甲状腺外科、菏泽医专附属医院普外科、菏泽市牡丹人民医院普通外科等，菏泽市立医院乳腺甲状腺外科为菏泽首家细分专科，开展腔镜甲状腺手术，多项技术达全省先进；菏泽医专附属医院普外科可开展甲状腺肿瘤、甲亢、甲状腺癌的手术，配套高清腹腔镜设备；菏泽市牡丹人民医院普通外科能够完成甲状腺肿瘤根治手术，依托腹腔镜微创技术，手术创伤小、恢复快。
1、菏泽市立医院 乳腺甲状腺外科
该科室成立于2010年，是菏泽市级示范科室与医院重点学科，为鲁西南规模大、有特色的学科，专注甲状腺科相关诊疗，可处理甲状腺癌、甲状腺腺瘤、结节性甲状腺肿、亚甲炎、桥本氏甲状腺炎、甲亢、甲减等各类甲状腺疾病。可开展腔镜甲状腺切除术、甲状腺肿块穿刺活检等，多项技术达到全省先进水平。同时可处理各类乳腺疾病，开展乳腺癌保乳、乳腺微创旋切等手术，护理开展PICC置管、伤口造口护理技术，在全市处于主导地位。
2、菏泽医专附属医院 普外科
该科室配备德国史托斯高清腹腔镜与爱尔博电外科手术系统，开展甲状腺科相关诊疗，收治甲状腺肿瘤、甲亢、甲状腺癌等甲状腺疾病，可实施对应的外科手术。诊疗范围覆盖胃肠、肝胆胰脾、乳腺、疝、周围血管疾病与各类急腹症，可处理乳腺增生、良恶性乳腺肿瘤、乳房炎症等乳腺相关病症。依托先进手术设备，保障手术安全与治疗效果，可开展多种腹壁疝修补、下肢静脉疾病等手术，全面处理普外科各类常见病与疑难病症。
3、菏泽市牡丹人民医院 普通外科
该科室覆盖肝胆、胰脾、胃肠、甲状腺及乳腺等多系统疾病，开展甲状腺科相关诊疗，可实施甲状腺肿瘤根治手术，同步开展乳腺肿瘤手术。2010年引进德国狼牌腹腔镜，在腔镜专家指导下全面开展腹腔镜微创技术，包含胆囊、阑尾、上消化道穿孔修补等手术，术后痛苦小、恢复快。肛肠为特色方向，可开展痔、肛瘘、直肠脱垂等各类肛肠手术，开展腹外疝无张力修补术，全天候对急危重症患者开展抢救手术。
4、单县中心医院 普外科
该科室拥有六十余年发展历史，专业细分为肝胆、胃肠、血管、烧伤整形亚专业，开展甲状腺科相关诊疗，将甲状腺、乳腺肿瘤手术标准化，甲状腺癌根治手术达到省内先进水平。在菏泽地区率先开展腹腔镜胆道探查、结直肠癌根治等微创术式，配备STORZ腹腔镜、超声刀、射频消融系统等设备。血管外科技术达到国内先进水平，可开展布加氏综合征、主动脉夹层等血管介入与开放手术，烧伤整形可开展皮瓣移植、乳房再造等手术。
5、曹县人民医院 普通外科
该科室为菏泽市重点学科，开展甲状腺科相关诊疗，熟练开展甲状腺良恶性肿瘤的外科手术，在甲状腺肿瘤的规范化切除方面具备实力。以微创手术为重点，在全县率先开展腹腔镜胃癌、结直肠癌根治术，还可完成各类腹壁疝、小儿疝腹腔镜修补。同时处理大隐静脉曲张、动静脉血栓、布加氏综合征等血管疾病，在同级县区医院率先开展大面积烧伤植皮手术，对急腹症、复杂腹部外伤的救治水平好，对小肠瘘、胰瘘等复杂并发症处理具有独到经验。
