上海肿瘤科医院排名靠前的是复旦大学附属肿瘤医院肿瘤内科、复旦大学附属中山医院肿瘤内科、上海交通大学医学院附属瑞金医院肿瘤科等。复旦大学附属肿瘤医院肿瘤内科2021-2023年复旦版全国肿瘤专科排名稳居全国第3位，是国内规模最大、学术力量最雄厚的肿瘤学医教研基地之一，也是国内最早设立的少数几家肿瘤内科之一。复旦大学附属中山医院肿瘤内科2023年跻身复旦版全国肿瘤专科声誉提名行列，是上海市肿瘤化疗质量控制中心组长单位，具备肿瘤学Ⅰ-Ⅳ期全阶段临床研究资质。上海交通大学医学院附属瑞金医院肿瘤科是第四批国家临床重点专科建设科室、FDA批准的肿瘤新药临床试验基地，以胃肠、乳腺、胰腺等我国高发实体瘤的化学治疗、靶向治疗、新药临床研究为核心特色。
1、复旦大学附属肿瘤医院 肿瘤内科
该科室前身可追溯至1958年组建的国内首批肿瘤化疗小组，1965年正式建科，是国内最早获批的抗肿瘤药物南方基地。科室有三分之一医师有海外深造经历，形成了结构合理的人才梯队，年门诊量约6万人次、年收治住院患者超5000人次，肿瘤内科门诊量位列全国首位。作为上海市肿瘤化疗质控中心挂靠单位，科室负责全市96家大中型医院的肿瘤化疗质量管控，建科数十年未发生医疗事故，在淋巴瘤、肺癌、乳腺癌、胃肠肿瘤诊疗领域享誉全国。
2、复旦大学附属中山医院 肿瘤内科
该科室2006年正式建制，是上海市肿瘤化疗质量控制中心组长单位。科室以化疗、靶向、免疫治疗为核心，结合高强度聚焦超声、腹腔热灌注等局部治疗手段，为患者提供基于循证证据的规范化、个体化诊疗。科室较早获得肿瘤学Ⅰ-Ⅳ期临床研究资质，累计完成及在研国内国际新药、细胞治疗临床研究300余项，可为符合条件的患者提供前沿治疗机会。科室牵头搭建胃肠道、胆胰、乳腺、腹部软组织肿瘤等多学科诊疗团队，成立免疫治疗不良反应、肿瘤营养两大特色MDT，组建中山医院医联体肿瘤专科联盟，在消化道肿瘤、软组织肿瘤诊治领域处于国内领先地位，难治性、罕见肿瘤诊治特色鲜明。
3、上海交通大学医学院附属瑞金医院 肿瘤科
该科室是第四批国家临床重点专科建设科室、FDA批准的肿瘤新药临床试验基地、首批上海市癌痛规范化病房、肿瘤学专业博士点。科室现有床位81张，年收治肿瘤患者逾万人次，胃癌、结直肠癌、乳腺癌等5大优势病种占收治量的85%以上；医师团队中硕博占比85.7%，海外研习归国人员占比超50%。科室3年来累计承担国家科技支撑计划1项、国家自然科学基金3项，以组长单位主持或参与各级多中心临床试验7项，执笔参编国家卫健委、CSCO肿瘤诊疗规范4部。科室凝练肿瘤精准医疗“三个导向”理念，常态运行10个肿瘤MDT门诊，胃肠、乳腺肿瘤亚专科达到或接近国际先进水平，床位使用率近125%、平均住院日近3天。
4、复旦大学附属华山医院 肿瘤科
该科室2002年正式建科，2014年获评卫生部国家临床重点专科建设项目。科室坚持多学科诊治、循证医学、规范化与个体化结合的诊疗理念，常规开展脑转移瘤、肺癌、乳腺癌、消化道肿瘤、淋巴瘤等十余种实体肿瘤的化疗、靶向、微创治疗。科室累计承担国家自然科学基金等各级科研项目，发表SCI论文近20篇，其中2篇论文分别被ASCO、ESMO纳入非小细胞肺癌指南、小细胞肺癌共识的制定参考依据。科室依托医院神经学科优势，将恶性肿瘤脑转移诊治打造为核心特色，主办的脑转移瘤多学科诊治论坛在行业内具备广泛影响力；此外在原发灶不明肿瘤诊治、大剂量化疗联合造血干细胞移植、肿瘤消融介入、癌痛规范化管理等领域经验丰富。
5、上海交通大学医学院附属仁济医院 肿瘤科
该科室是上海市临床重点专科、上海市“重中之重”临床医学中心、上海市教委肿瘤学重点学科，在2018年度中国医院科技量值（肿瘤学）评价中位列综合性医院第5位。科室建立12个肿瘤MDT，在全国率先成立MDT专家委员会，搭建集肿瘤预防、诊断、治疗、康复于一体的服务平台，建成上海最大的肿瘤日间化疗中心，泌尿、消化、妇科肿瘤为核心优势学科。科室肿瘤相关国家自然科学基金项目数量位居上海市综合医院第一，牵头建立国内首个呼吸活检实验室探索肺癌早筛，是国内首个国外已上市抗肿瘤新药试点单位，现为上海交大医学院肿瘤专科医师培训专家组组长单位、上海市肿瘤内科专科规培基地，牵头搭建跨院跨学科肿瘤专科培训平台。
