云南胃肠外科医院排名比较靠前的是昆明医科大学第一附属医院、昆明医科大学第二附属医院、解放军联勤保障部九二零医院。
昆明医科大学第一附属医院胃肠与疝外科胃肠肿瘤治疗处于省内领先地位，腹腔镜疝修补手术水平稳居西南地区领先行列。昆明医科大学第二附属医院胃肠外科由著名外科专家蓝瑚教授创建，在省内率先开展低位直肠癌taTME手术及恶性肿瘤腹腔热灌注治疗。解放军联勤保障部九二零医院普通外科在肠外瘘及蛇咬伤救治方面达到世界先进水平，腹腔镜微创技术处于云南省领先地位。
1.昆明医科大学第一附属医院 胃肠与疝外科
昆明医科大学第一附属医院胃肠与疝外科是云南省胃肠肿瘤规范化、个体化及微创化治疗的领跑者。科室不仅完成了院内多例首屈一指的腹腔镜胃肠道肿瘤及胰十二指肠切除术，其腹股沟疝、造瘘口旁疝及食道裂孔疝的腹腔镜修补水平更在西南地区处于领先地位。科室承担多项国家自然基金及黎介寿院士基金项目，每季度举办腹腔镜培训班，为西南地区输送了大量顶尖微创外科人才。
2.昆明医科大学第二附属医院 胃肠外科
昆明医科大学第二附属医院胃肠外科由我国著名外科专家蓝瑚教授创建，是孕育云南省普通外科高级专家与科室主任的摇篮。科室在省内率先提出复杂急腹症肠“Y型造瘘”手术方式，并率先开展单孔加一孔及机器人胃结直肠癌根治术。贴近肿瘤治疗前沿，科室首家在省内开展恶性肿瘤腹腔热灌注治疗，将手术与热疗完美结合，DRGS评分连续五年稳居全省前列，科研与临床实力省内一流。
3.解放军联勤保障部九二零医院 普通外科
解放军联勤保障部九二零医院普通外科坚持“以临床研究为基础、肿瘤防治为重点”方针，在乳腺癌与直肠癌综合治疗上成果丰硕。科室特色极为鲜明，在严重腹部外伤及肠瘘救治上总结出系统方案并长期居全省前列；与中科院联合研制的特效“蛇伤药盒”救治数百例濒死患者，获军队科技进步二等奖与省科技进步一等奖，蛇咬伤防治达世界先进水平。在省内率先大规模开展腹腔镜疝及结直肠癌手术。
4.云南省第一人民医院 普外科
云南省第一人民医院普外科是该省本专业建立最早的专科，在省内较早开展血管介入微创疗、胸腹主动脉瘤支架型人工血管腔内移植等国际尖端技术。在胃肿瘤、肠道肿瘤等消化道癌的诊治上居省内先进水平，部分疾病治疗为全省领先。科室率先开展肠外与肠内营养的临床应用研究，在肠瘘和重度营养不良患者的救治上优势极其显著。
5.云南大学附属医院 普通外科
云南大学附属医院普通外科是国家临床重点专科，设有云南省腹部微创外科研究中心及碘125粒子植入治疗恶性肿瘤研究中心。科室下设胃肠、微创、疝、乳腺甲状腺及减重代谢等多个亚专业学组，多项技术达国内领先水平。与美国安德森癌症中心等国际顶尖机构长期合作，获国家自然基金及省部级重大项目资助，年均科研经费超百万元，斩获十余项省科技进步奖，SCI收录论文丰厚，是极具创新力的高地。
