湖南省肛门医院排名靠前的有中南大学湘雅医院、湖南省人民医院、湖南中医药大学第一附属医院等，中南大学湘雅医院普通外科包含肛门结直肠外科等亚专科，是教育部国家重点（培育）学科；湖南省人民医院肛肠外科，诊治方面在国内处于领先地位，是省级重点学科；湖南中医药大学第一附属医院肛肠科，在肛肠疾病的诊断和治疗方面均居国内领先水平。
第一名：中南大学湘雅医院-普通外科
中南大学湘雅医院普通外科是新中国最早成立的普通外科之一，已经发展成集医疗、教学、科研为一体的国内知名普通外科中心。现为教育部国家重点（培育）学科，“十二五”国家临床重点专科，复旦学科排名全国第15（2020年度），中南大学湘雅医院“优势学科”。拥有肝脏外科、胆道外科、胰腺外科、胃肠外科、肛门结直肠外科等共11个亚专科。
第二名：湖南省人民医院-肛肠外科
湖南省人民医院肛肠外科医疗设备齐全，有较先进的肛肠疾病诊治中心。科室在结直肠肿瘤规范化诊治、中晚期结直肠癌多学科综合诊治方面在国内处于领先地位，参与我国在该领域诊疗规范的编写和制定。科室2010年被中华中医药学会肛肠外科分会评为“名医先进工作室”。2011年被中华中医药学会授予“湖南省中西医结合诊治肛肠疾病示范单位”。2015年被省卫健委接予省级重点学科。
第三名：湖南中医药大学第一附属医院-肛肠科
湖南中医药大学第一附属医院肛肠科，是集医疗、教学、科研为一体的综合性专科，科室具有鲜明的中医专科特色，在肛肠疾病的诊断和治疗方面均居国内领先水平，在湖南省乃至全国均具有一定的影响力。科室技术力量雄厚，已广泛开展国内现有肛肠诊疗新技术，对炎性肠病、肠道恶性肿瘤、重度直肠脱垂及小儿肛肠疾病的中西治疗有显著疗效，在广大肛肠病患者中享有良好的口碑。
第四名：中南大学湘雅医学院附属株洲医院-肛肠外科
中南大学湘雅医学院附属株洲医院肛肠外科目前诊治范围有内、外痔、混合痔及环状痔注射治疗，手术治疗包括套扎（RPH）术、外剥内扎术、PPH术、及TST术，肛周脓肿、复杂性肛瘘根治性手术及复发性肛瘘手术治疗，直肠粘膜重度脱垂（脱肛）根治性手术治疗等。专业领域在株洲市一直处于绝对领先地位，在省内同行业中也达到了先进水平。
第五名：长沙市第一医院-普外科
长沙市第一医院普外科，至今已发展成为专业齐全，技术力量雄厚，集医疗、教学、科研于一体的科室。先后引进一整套先进的外科诊疗设备以满足临床诊治需要，包括磁共振机（MRI）、双螺旋CT、数字减影血管造影（DSA）及介入治疗设备等。诊疗范围包括腹腔镜微创外科、肝胆外科、血管外科、肛肠外科、腹壁疝外科、消化道肿瘤外科及重症胰腺炎的治疗等。
