北京牙周科医院排行榜靠前的是北京大学口腔医院、首都医科大学附属北京口腔医院、北京大学口腔医院第二门诊部。
北京大学口腔医院全国牙周病学临床重点专科榜首，疑难重症诊治与学科建设为行业标杆。首都医科大学附属北京口腔医院临床诊疗技术先进，特色门诊与前沿设备兼备，科研与临床结合紧密，区域接诊服务能力突出。北京大学口腔医院第二门诊部接轨国际牙周诊疗标准，承担顶尖院校研究生临床培训，学术交流广泛。
1.北京大学口腔医院 牙周科
全国牙周病学专业国家临床重点专科第一名，是集医疗、教学、科研于一体的行业标杆科室，诊疗技术达国际水平。坚持牙周疾病规范化系统治疗，对重度复杂牙周炎开展牙周主导的多学科治疗，成功保留数万计患者天然牙；率先在国内开展牙周组织再生、美学区牙周成形重建、牙周病种植及种植体周围病治疗。能确诊并治疗掌跖角化-牙周破坏综合征等多种疑难病。
团队实力雄厚，91%医师拥有博士学位，承担中央首长牙周保健工作。教学上为全国最早牙周病学博士点、博士后流动站，是《牙周病学》等国家级规划教材主编单位，主持撰写我国首部《中国牙周病防治指南》，为国家级继续教育培训基地；科研上近15年获国家自然科学基金28项、省部级基金26项，发表SCI论文100余篇，斩获多项省部级奖项。
2.首都医科大学附属北京口腔医院 牙周科
集临床、教学、科研于一体，核心开展急慢性牙龈炎、各类牙周炎的系统治疗，在完善基础治疗的同时，开展牙龈切除术、牙周组织再生术等各类牙周手术。诊疗技术先进，开设特色门诊，采用超声龈下刮治、牙周“一站式”治疗减轻患者痛苦、缩短疗程。通过松牙固定术提升咀嚼功能，开展义龈修复、膜龈手术改善美观，引进激光牙周治疗仪、牙周显微镜等国际先进仪器。
依托实力雄厚的基础教研室开展微生物学、基因学等基础研究，获3项国家级课题、多项北京市级课题，2人获北京市新星计划资助，在国内外核心期刊发表论著50余篇，多项研究获市、局级科研成果年接诊患者4万余人次，秉持“以患者为中心”提升服务质量与资源利用率。
3.北京大学口腔医院第二门诊部 牙周科
该科承担北京大学-香港大学牙周专业研究生临床培训任务，与国际牙周病学界联系密切、学术交流广泛。科内医师多拥有硕、博士学位，诊疗能力接轨国际，除提供洁治、刮治、牙周翻瓣术等牙周病常规治疗外，还开展引导牙周组织再生植骨术、膜龈手术、牙周美容手术，以及牙齿缺失后的牙种植手术等高端牙周专科治疗，诊疗项目全面且专业。
4.北京大学口腔医院门诊部 牙周科
与总院牙周科同源，始医教研体系与总院一致，诊疗技术达国际水平。坚持牙周疾病规范化系统治疗，开展重度复杂牙周炎多学科治疗，率先开展牙周组织再生、美学区牙周成形重建等前沿技术，能确诊并治疗各类牙周疑难病。团队、设备、接诊能力与总院同步。
拥有高学历、高职称医师团队，配教学上为牙周病学教学示范单位、全国最早博士点及博士后流动站，主编多部国家级规划教材，主持撰写《中国牙周病防治指南》；科研上获多项国家、省部级基金，发表大量SCI论文，学术成果丰硕，同时承担全国进修医师培训、国家级牙周临床专项技术培训等工作。
5.北京大学口腔医院第三门诊部 牙周科
与总院、门诊部牙周科一脉相承，集医疗、教学、科研于一体，诊疗技术达国际水平。核心开展牙周疾病规范化系统治疗，对重度复杂牙周炎实施多学科联合治疗，保留患者天然牙；率先在国内开展牙周组织再生、美学及功能区牙周成形重建、牙周种植等前沿技术，擅长各类牙周疑难病的确诊与针对性治疗。
