先天性心脏病建议就诊于心血管内科，江苏治疗先天性心脏病医院排名靠前的是南京市儿童医院心血管内科、江苏省人民医院儿科、东南大学附属中大医院儿科等，南京市儿童医院心血管内科是江苏省先天性心脏病诊疗中心，累计完成先心病介入治疗6000余例；江苏省人民医院儿科设有心血管亚专业，可联合小儿胸心外科完成先心病围手术期重症监护；东南大学附属中大医院儿科可开展先天性心脏病规范诊疗，配套危重新生儿转运救治体系。
1、南京市儿童医院 心血管内科
该科室2023年全国专科声誉排名提名，是国内知名小儿心血管疾病诊疗中心，可开展先天性心脏病介入封堵，省内率先开展可吸收材料介入封堵与儿童左束支起搏技术，斩获省卫健委医学新技术引进奖二等奖。同时开展儿童心脏射频消融、罕见代谢性心肌病遗传诊断，对川崎病合并冠脉病变实施规范化管理与冠脉造影评估，承担多项国家级、省市级科研课题，常年主办国家级继续教育学习班，每年产出多篇高质量科研论文。
2、江苏省人民医院 儿科
该科室为省级临床重点专科、省级新生儿危急重症救治指导中心，设有心血管亚专业，能够配合小儿胸心外科开展先天性心脏病围手术期监护救治，承接省内重症先心病患儿托底诊疗。还开展儿童造血干细胞移植、ECMO、CRRT、支气管镜、胃肠镜等多项救治技术，覆盖血液肿瘤、呼吸、消化、内分泌、神经、罕见病等多个方向，拥有博士、硕士学位授予点与博士后流动站，承担多项国家级自然科学基金项目，发表数百篇SCI论文，收获多项省市级科技成果奖项。
3、南京鼓楼医院 儿科
该科室依托综合医院强大的学科平台，可完成先天性心脏病的基础筛查与综合管理，同步开展儿童呼吸、肾脏、风湿免疫、内分泌、新生儿疾病的临床诊疗，配套儿童保健服务，设置专家门诊、普通门诊、抢救室、雾化室等功能区域。紧跟前沿诊疗理念，持续引进高层次人才，兼顾临床、教学与科研工作，遵循鼓医博爱、精湛高雅的院训，为患儿提供规范的诊疗服务，处理各类儿科常见病与多发病。
4、东南大学附属中大医院 儿科
该科室是江苏省临床重点专科，可规范开展先天性心脏病诊疗，在南京地区率先搭建危重新生儿救护转运系统，每年转运苏皖地区危重新生儿1200余名，也是省内首家开展早产儿视网膜病筛查的单位。同时开展新生儿袋鼠疗法、高危儿康复干预、感觉统合训练，对喘息性疾病、癫痫、矮身材、性早熟、遗传代谢病进行系统诊治，承担国家973课题、国家自然基金等项目，与德国乌尔姆大学医学院长期学术交流，多次斩获省市级科技进步奖。
5、苏州大学附属第一医院 儿科
该科室历史悠久，1957年以此为基础组建苏大附属儿童医院，持续保留儿科门诊并开设专科特色诊疗项目，依托三甲综合医院多学科协作优势，可开展先天性心脏病的基础评估与转诊对接。秉持用心呵护患儿、用情温暖家属的服务理念，为儿童提供全方位诊疗服务，兼顾儿童常见病、多发病以及各类儿科专科疾病的接诊处置，持续优化门诊诊疗流程，满足本地及周边患儿日常就医需求。
