深圳中医消化科医院排名比较靠前的是深圳市人民医院、深圳市第三人民医院、北京大学深圳医院。
深圳市人民医院中医科为省级中医重点专科创建单位，消化疾病诊疗经验丰富，中医特色疗法齐全。深圳市第三人民医院中医内科依托感染病研究平台，在肝病、脾胃病等消化疑难病症诊疗水平突出。北京大学深圳医院中医科消化专科体系完善，对多种胃肠肝胆疾病中西医结合疗效显著。
1.深圳市人民医院 中医科
深圳市人民医院中医科是广东省中医重点专科创建单位，暨南大学中西医结合硕博培养专业，拥有省市级名中医团队。科室开展中药灌肠、穴位贴敷等多种特色疗法，是深圳中医药适宜技术培训基地，在消化系统疾病、老年病及血栓相关疾病诊疗上成果突出，承担多项科研课题，在深港澳地区声誉较高。
2.深圳市第三人民医院 中医内科
深圳市第三人民医院中医内科是省级中医药防治传染病重点学科，拥有高层次人才及博硕导师团队，承担多项国家级传染病科研课题并获多项科技奖励。科室在肝病、脾胃病等消化内科疑难杂症诊疗上优势明显，对癌前病变、重度黄疸的中西医结合救治达国内先进水平，理疗与中医外治项目丰富。
3.北京大学深圳医院 中医科
北京大学深圳医院中医科团队均有国家级重点专科进修经历，开设专门消化专科，擅长治疗Hp相关疾病、慢性胃炎、消化性溃疡、反流性食管炎、脂肪肝等胃肠肝胆疾病。科室运用中药内服配合针灸、拔罐、穴位贴敷等特色疗法，患者满意度高，吸引众多外地疑难病患者就诊。
4.深圳市第二人民医院 中医科
深圳市第二人民医院中医科是全国综合医院中医药示范单位、省级中医老年病重点专科，为华南区域中医老年病诊疗协作核心单位。科室设有中西医结合脾胃病亚专科，研制系列院内协定处方，在慢性消化系统疾病诊疗上疗效显著，依托院士团队开展科研合作，教学与科研实力位居深圳前列。
5.中山大学附属第八医院 中医科
中山大学附属第八医院中医科是市级中医重点培育专科，建有国家级中西医协同旗舰科室及名中医传承工作室，引进多名省级名中医团队。科室以化痰法治疗脾胃病等疑难杂症为特色，开展针挑、精灸等新技术，联合西医科室开展中西医协同诊疗，内服外治结合，在脾胃病、心脑血管及肿瘤术后调理上优势突出。
