广元市精神卫生中心擅长的科室有骨科、消化内科、睡眠医学科、儿少精神科等。
1、骨科
广元市精神卫生中心骨科，是市级重点专科，配备的专用手术床，关节镜，床边X光机，“C”臂X线透视成像机、髋膝关节恒动机、创伤治疗仪，气压治疗仪等先进设备。开展各种复杂创伤急救、各类疑难病及慢性病的诊治和名类骨折内固定手术、人工股骨头置换术、全髋、膝关节置换术、脊柱骨折切开复位内固定术、椎间盘摘除术、复杂骨盆骨折切开复位术、骨肿瘤进行切除和根治性手术以及骨髓炎手术。
2、消化内科
广元市精神卫生中心消化内科，是四川省甲级重点消化专科，国家消化道早癌广元中心（简称GICC中心）。科内设立有胶囊内镜研究室、力源名医工作室、内镜中心。长期以来在消化系统疑难急危重病例的管理方面积累了丰富的经验。覆盖病种丰富，医疗设备先进且齐全。科室承担了的多项课题科研，并承担川北医学院、达职院基地班教学授课，以及消化专业的实习、规培、进修、转岗带教等。
3、睡眠医学科
广元市精神卫生中心睡眠医学科，省级重点专科，实行开放式住院治疗，开设失眠门诊、心理门诊、睡眠医学科（住院部）、心理功能治疗室、多导睡眠监测室、物理治疗室等。与德国柏林大学附属夏里特医院共建中德睡眠中心，是广元市睡眠医学专委会挂靠科室，也是川东北及川陕甘结合部地区唯一集医、教、研为一体的高水平睡眠医学中心。
4、儿少精神科
广元市精神卫生中心儿少精神科，是省级重点专科，是市孤独症康复协会挂靠科室。设门诊、住院病区和康复中心。科室为全开放式管理，配有专业的心理治疗师和康疗室。开展儿童青少年各类心理障碍（焦虑抑郁障碍、情绪障碍等）、精神障碍（精神分裂症、双相情感障碍、精神活性物质所致精神障碍等）、发育障碍及行为障碍（精神发育迟滞、抽动障碍、注意缺陷与多动障碍、儿童孤独症等）的诊断治疗。