牡丹江耳鼻喉科比较好的医院是牡丹江医学院附属第二医院、牡丹江市第二人民医院、黑龙江省牡丹江林业中心医院，牡丹江医学院附属第二医院耳鼻喉科为院重点科室，能熟练开展内镜下鼻咽部巨大肿瘤切除、咽部及咽旁的肿瘤切除、鼓膜修补等技术。牡丹江市第二人民医院的耳鼻咽喉头颈外科是牡丹江地区耳鼻咽喉科疑难杂症诊治中心；黑龙江省牡丹江林业中心医院的耳鼻咽喉科医疗水平在牡市及周边林区处于领先地位。
第一名：牡丹江医学院附属第二医院-耳鼻喉科
牡丹江医学院附属第二医院耳鼻喉科为医院重点科室，是牡丹江地区最早开展鼻内窥镜下手术治疗慢性鼻窦炎、鼻息肉和鼻腔、鼻窦良恶性肿瘤和鼻中隔偏曲的科室。并能熟练开展悬雍垂腭咽成形术治疗阻塞性睡眠呼吸暂停综合征、内镜下鼻咽部巨大肿瘤切除、咽部及咽旁的肿瘤切除、电子支撑喉镜显示系统下的喉部微创手术、内镜下经口腺样体、扁桃体切除术、颈淋巴结清扫术；鼓膜修补、乳突根治术、鼓室成形术治疗中耳炎等。
第二名：牡丹江市第二人民医院-耳鼻咽喉头颈外科
牡丹江市第二人民医院耳鼻咽喉头颈外科是牡丹江地区耳鼻咽喉科疑难杂症诊治中心，拥有多功能内窥镜显示系统、电测听、声导抗检查仪、耳鸣治疗仪、鼻窦内窥镜、纤维喉镜、气管镜、食管镜、支撑喉镜等市内领先医疗器械。能够开展大量一般手术及高难度手术，如喉癌的半喉及全喉切除术、睡眠呼吸暂停综合症的腭咽成形术、鼻内窥镜下治疗鼻窦炎、鼻中隔矫正术等。
第三名：黑龙江省牡丹江林业中心医院-耳鼻咽喉科
黑龙江省牡丹江林业中心医院耳鼻咽喉科，自1950年建院至今己经过了近60余年的发展，医疗水平在牡市及周边林区处于领先地位。科室对突发性耳聋治疗有专科治疗方案，极大提高患耳恢复率，提高了患者生活满意度，成为林医耳鼻喉科一大治疗特色。另外功能性失音采用针灸疗法能让患者即时发声，取得立竿见影效果，成为林医耳鼻喉科另一大治疗特色。
第四名：牡丹江市第一人民医院-耳鼻喉科
牡丹江市第一人民医院耳鼻喉科现发展为省内东南部地区省级重点专业学科，数年连任牡丹江市一级重点专科。科室医疗设备先进，开展多项诊疗业务，其中数项填补市内空白和市内领先业务，如在牡丹江市首先开展了鼻内窥镜手术，使许多慢性鼻病的治疗达到一个新的水平，得到全市同人的认可。
第五名：牡丹江医学院附属红旗医院-耳鼻咽喉科
牡丹江医学院附属红旗医院耳鼻咽喉科多年来，在全体医务人员的共同努力下，基本掌握了国内外的先进性技术和经验，并应用于临床，完成各种常见病，多发病的诊断及治疗工作，对本专业的疑难杂症及危重病人，诊断正确，抢救及时。如鼻部、咽部、良恶性肿瘤的手术治疗，鼾症的手术治疗、慢性中耳炎并颅内并发症的手术治疗、气管异物、食道异物的治疗，鼻内窥镜手术及鼻出血及耳聋的治疗。
